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广西狂犬病野毒株L基因3′端的克隆和序列分析的任务书
任务名称:广西狂犬病野毒株L基因3′端的克隆和序列分析
任务背景:
狂犬病是一种由病毒引起的致命性疾病,通过受感染动物的唾液传播。广西地区为狂犬病高发区,野生动物等多种动物都存在携带狂犬病毒感染。因此,了解广西地区狂犬病毒的分布和传播情况,对于制定有效的防控措施具有重要意义。
本次任务旨在对广西地区野生动物携带的狂犬病毒采集样品进行L基因3′端的克隆和序列分析,以期了解该病毒株的遗传特征,为狂犬病的防治提供科学依据。
任务目标:
1.收集广西地区采集的狂犬病毒阳性样品,使用PCR技术扩增L基因3′端。
2.将扩增得到的目标片段进行纯化、测序和分析,在NCBI数据库中进行比对和序列分析。
3.通过对比分析狂犬病毒不同株系的L基因序列,探索广西地区狂犬病毒的遗传特征。
任务步骤:
1.检索已有的文献和数据库,获取广西地区野生动物携带的狂犬病毒的相关信息。
2.采集符合标准的狂犬病毒阳性样品,提取样品DNA。
3.设计引物,利用PCR技术扩增L基因3′端。
4.将扩增得到的目标片段进行纯化、测序和分析,对其进行序列比对和分析。
5.利用生物信息学方法,比较广西地区狂犬病毒与其他狂犬病毒株系的遗传关系和多样性。
6.绘制狂犬病毒L基因3′端的进化树,以揭示广西地区狂犬病毒的演化过程。
7.撰写报告,总结分析结果,提出对广西地区狂犬病毒防控的建议。
参考文献:
1.Feng,Y.,Wang,X.,Yu,M.,etal.(2016).MolecularepidemiologyofrabiesinsouthernPeople’sRepublicofChina.EmergInfectDis,22(3),486-8.
2.Guo,Z.,Tao,X.,Yin,C.,etal.(2018).CompletegenomeofastreetrabiesvirusisolatedinsouthChina.VirusGenes,54(6),790-799.
3.Vázquez-Morón,S.,Juste,J.,Ibá?ez,C.,etal.(2008).PhylogeographyofthefoxrabiesvirusinsouthwesternEurope.Virology,380(2),1-9.
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