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本发明公开了一种限制插入位置的单面基因组片段填充方法及装置。该方法主要包括以下步骤:参照完整基因组,遍历不完整的基因组片段,得到缺失基因集合、初始匹配块集合、有序断点集合,其中求初始匹配块可通过计算最长公共子串来实现;查找缺失基因中的双端型缺失基因,并在对应断点处插入双端插入型缺失基因;通过多次反转所有集合中的序列,交替在现有的匹配块或者有序断点的首端和尾端插入缺失基因,从而增加有序保留对的数量;调整填充后的基因序列方向为正向,并输出该序列。该填充方法拥有处理速度快、效率高、成本低等优点。本发明
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117690479A
(43)申请公布日2024.03.12
(21)申请号202311804303.4
(22)申请日2023.12.26
(71)申请人山东建筑大学
地址250101
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