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本发明公开了一种基于图深度学习的空间转录组学中空间域识别方法,主要解决现有空间域识别技术存在运行时间长,内存消耗大,数据适应性差的问题。其实现方案是:对获取的空间转录组数据中的基因表达数据进行预处理和数据增强;根据预处理后的数据和空间坐标信息矩阵构建增强邻接图;建立一个包括图注意力网络和多层感知器网络组成的特征提取模型;通过掩码损失训练该模型,生成每个像素点的低维嵌入表示;对所有低维嵌入表示进行聚类得到空间域。本发明在缺少组织学图像信息的情况下,避免了获得组织学图像所付出的高额成本,及输入组织学
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117708628A
(43)申请公布日2024.03.15
(21)申请号202311673334.0G16B25/00(2019.01)
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