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杉木EST-SSR标记的开发与应用的中期报告

本中期报告旨在介绍杉木EST-SSR标记的开发与应用的进展情况。

一、研究背景与意义

杉木是中国北方重要的经济林种，也是世界重要的造林树种之一。随着生态环境问题的加重和人类经济社会的发展，对杉木品种的需求在不断增加。因此，开发高效、精准的分子标记对杉木品种资源的保护、改良和利用具有重要的应用价值。

二、研究内容

本研究选用杉木基因组EST序列为基础，设计EST-SSR标记并进行PCR扩增、检测和分析。同时，对所开发的EST-SSR标记进行了应用研究，包括种质资源分析、亲缘关系分析、群体遗传结构分析等。

三、研究结果

1、杉木EST序列筛选及EST-SSR标记开发

本研究通过对已有杉木EST序列数据库的筛选和分析，获得了一批具有SSR位点的EST序列共计3977条。根据SSR类型和长度，设计了180对EST-SSR引物并进行PCR扩增。最终，获得了97对引物成功PCR扩增出杉木品种的多态性位点。

2、EST-SSR标记的应用研究

本研究对所开发的EST-SSR标记进行了应用研究，包括种质资源分析、亲缘关系分析、群体遗传结构分析等。

（1）种质资源分析

本研究选取了15个杉木种质资源，共测定了87个EST-SSR位点。结果显示，这些EST-SSR标记在杉木品种间具有较高的遗传多样性，基因多样性指数（He）平均值为0.364，有效等位基因数（Ne）平均值为2.349。

（2）亲缘关系分析

本研究利用68个EST-SSR位点对10个杉木品种进行了亲缘关系分析。结果表明，这些杉木品种的遗传相似度在0.514-0.950之间，存在较大的遗传差异。

（3）群体遗传结构分析

本研究选取了3个来自不同地区的杉木种群，利用42个EST-SSR位点进行了群体遗传结构分析。结果显示，这些杉木种群在遗传结构上存在一定的差异性，不同种群之间的遗传相似度在0.718-0.838之间。

四、研究结论

1、杉木基因组EST序列具有较高的SSR位点密度和多样性；

2、通过对杉木EST序列的筛选和分析，开发了97对具有优异遗传多样性的EST-SSR标记；

3、应用所开发的EST-SSR标记进行了种质资源分析、亲缘关系分析和群体遗传结构分析，结果表明这些标记在杉木分子遗传学研究中具有较好的应用价值。