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肝细胞癌DNA甲基化谱实验研究的任务书
一、背景
肝细胞癌（HCC）是一种常见的癌症类型，尤其在亚洲地区发病率高，且死亡率也高。HCC的治疗和预防仍然具有挑战性，因此需要深入研究其病理机制和潜在的分子靶点。DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰，已经在肿瘤发生和发展过程中得到了广泛的研究。
二、研究目的
本研究旨在利用高通量组学技术，构建HCC组织与正常肝组织DNA甲基化谱，探究HCCDNA甲基化的变化及其可能的分子机制，为HCC分子诊断和治疗提供新的理论支持。
三、研究内容
1.采集30例肝细胞癌患者及30例正常对照组的组织样本（选取早期患者），提取组织DNA；
2.采用IlluminaInfiniumHumanMethylation450BeadChip芯片分析DNA甲基化水平，对数据进行初步质量控制和预处理；
3.对甲基化谱的差异区域进行统计学分析，并进行GO分析、KEGG通路分析等功能富集分析；
4.将分析结果与公共数据库进行比对和验证，包括TCGA、GEO和其他RNAseq数据库；
5.将研究结果与肿瘤相关分子标志物和临床病理特征进行相关性分析。
四、研究意义
1.HCC的DNA甲基化谱的构建有助于进一步理解HCC的发生和发展机制，为HCC的治疗和预防提供新的分子靶点；
2.本研究可挖掘出具有潜在生物学意义的甲基化标记，对基于甲基化的肿瘤治疗和早期诊断提供有价值的指导；
3.本研究可为肝癌相关研究提供数据支撑和新的分析方法，促进肝癌的早期诊断和有效治疗。
五、研究进度安排
第一年：
1.样本采集、组织处理、DNA提取；
2._chip芯片甲基化实验；
3.数据质量控制和预处理。
第二年：
1.数据分析和差异区域富集分析；
2.外部数据验证和比对；
3.初步结果汇总和筛选。
第三年：
1.结果验证和差异位点分析；
2.结果解释和生物学意义探讨；
3.撰写论文和报告。
六、参考文献
1.SchernhammerES,ColditzGA.Suicideratesamongphysicians:aquantitativeandgenderassessment(meta-analysis).AmJPsychiatry.2004;161(12):2295-2302.
2.ShanafeltTD,BooneS,TanL,etal.Burnoutandsatisfactionwithwork-lifebalanceamongUSphysiciansrelativetothegeneralUSpopulation.ArchInternMed.2012;172(18):1377-1385.
3.WestCP,ShanafeltTD,KolarsJC.Qualityoflife,burnout,educationaldebt,andmedicalknowledgeamonginternalmedicineresidents.JAMA.2011;306(9):952-960.
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