济宁市城区生活污水中沙门菌分布、耐药特征及全基因组测序分析.docxVIP

现代预防医学2024年第51卷第5期ModernPreventiveMedicine,2024,vol.51,NO.5

.卫生监督.

济宁市城区生活污水中沙门菌分布、耐药特征及全基因组测序分析

王胜男1，祝园园2，杜照中1，聂天艳1，严强1

1.济宁市疾病预防控制中心微生物检验科，山东济宁272000;2.任城区疾病预防控制中心微生物检验科

摘要：目的了解济宁市城区生活污水中沙门菌分布、血清型、耐药特征，并进行全基因组测序分析，为沙门菌的防控提供科学依据。方法2023年2—3月，每周采集城区3个污水厂进水口污水各2份，每份500ml，连续采集7周，合计42份污水样本，对污水样本进行沙门菌的培养、分离、鉴定，分离出的沙门菌进行血清凝集试验和荧光定量PCR血清分型，利用微量肉汤稀释法对41株沙门菌进行9类17种药物的最低抑菌浓度(minimuminhibitoryconcentration，MIC)检测，进行全基因组测序及系统进化分析。结果济宁市城区生活污水沙门菌分离率较高，42份样本中阳性样本24份，共分离出41株沙门菌，属9种血清型，以阿贡纳和肯塔基为主，李营和济东污水厂有其独有的血清型。只有1株吉书沙门菌不耐药，其余40株沙门菌均为多重耐药菌，对复方新诺明、四环素、氨半西林、链霉素耐药率达90%以上，对氨半西林/舒巴坦耐药率达80%以上，共19种耐药谱，SXT-TET-STR-AMP-AMS占首位，不同血清型沙门菌的耐药谱不同，肯塔基沙门菌、黄金海岸沙门菌、婴儿沙门菌的多重耐药非常严重，同种血清型在不同污水厂中的耐药谱也不一致，李营污水厂的沙门菌耐药现象最严重。利用CARD数据库进行耐药基因预测，主要预测出8类耐药家族的18个耐药基因，耐药表型与耐药基因几乎全部一致。不同血清型沙门菌的ST分型不同，以ST13的阿贡纳沙门菌为主，进化树分为6个簇，不同污水厂的沙门菌在不同分支，提示基因组有差异，不同源。结论济宁市城区生活污水中沙门菌血清型多样，提示可能已在人群中存在并传播，耐药严重，携带耐药基因广泛，有些型别菌株持续存在且跨区域分布，有致病风险，需持续监测，并制定对科学的防控措施以控制沙门菌的流行及耐药的加重。

关键词：血清型;耐药谱;耐药基因;多位点序列分型;系统进化树

中图分类号：R378.22文献标志码：A文章编号：1003-8507（2024）05-930-07

DOI：10.20043/ki.MPM.202310202

Distribution,drugresistance,andgenomesequencinganalysisof

salmonellaindomesticsewageinJiningcity

WANGSheng-nan*,ZHUYuan-yuan,DUZhao一zhong,NIETian一yan,YINQiang

*Departmento∫Microbiology,Jiningcenter∫orDiseasecontrolandpre9ention,Jining,shandong272000,china

Abstract:ObjectiveTounderstandthedistribution,serotype,anddrugresistanceofsalmonellaindomesticsewageinJiningcity,andtoanalyzethewholegenomesequencingsoastoprovidescientificbasisforthepreventionandcontrolofsalmonella.MethodsFromFebruarytoMarchin2023,twosamplesofsewagefromtheintakeof3urbansewageplantswith500mleachwerecollectedcontinuouslyfor7weeks.Atotalof42sewagesampleswerecollectedforculture,isolation,andidentificationofsa