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种子生产与经营专业教学资源库;主要内容;一、实验目的
学习琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法,并掌握检测DNA的纯度、浓度与分子量的方法。
;二、实验原理
琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,沸水中溶解,45℃开始形成多孔行滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。
DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。不同DNA,其分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。
;三、实验材料
(一)材料
试验提取的植物DNA。
(二)试剂
琼脂糖、10xTBE电泳缓冲液。10x载样缓冲液、EB母液(0.5mg/ml)、λDNA(HindⅢ)。
;(三)仪器与用具
微波炉,电泳仪,微型电泳槽,凝胶成像系统、微量取液器、吸管头若干、加样板、量筒、三角瓶、透明胶带。
;四、实验步骤
(一)、制胶
1、称取1g琼脂糖加入盛有100ml0.5×TBE电泳缓冲液的5000ml三角瓶中,摇匀,用电子天平称三角瓶的总重量。在微波炉或者电炉上加热至琼脂糖完全溶解。冷却到约60℃后,加入5ul的Goldview(终浓度0.5ug/ml),并摇匀。
2、插入适当的梳子到制胶板,将溶解的琼脂糖倒入其中,直至厚度约4-6mm。
;3、冷却至室温。
4、充分凝固后拔出梳子,要保证点样孔完好。
5、将凝胶放入电泳槽中,加电泳缓冲液至液面覆盖凝胶1-2mm。
;(二)点样
1xTE或ddH2O:7μL
10ul混合液10xloadingbuffer:1ul
样品:2ul
混合后点入点样孔中。其中最左边的两个孔点5ulMarker3
作为分子量标准。
(三)电泳
打开电源开关,调节电压至3-5v/cm即100V,可见溴酚蓝
条带由负极向正极移动,约一小时可观察。
;(四)观察
用凝胶成像系统观察电泳好的凝胶,打开紫外灯,可以看到橙红色核酸条带,根据条带的粗细和荧光强度,可粗略估计样品DNA的浓度。同时根据已知标准DNA的分子量,通过线性DNA条带的位置初步估计样品分子量。
;五、实验注意事项;谢谢观看
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