重组体的筛选与鉴定【优秀完整版】.pptVIP

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重组体的筛选与鉴定;第六章重组体克隆的筛选和鉴定;转化子和重组子;选择(selection)筛选(screening)

选择:通过外来附加压力(或因素)的辨别作用,呈现具有重组DNA分子的特定克隆类型的一种方法。

筛选:通过特定的方法,例如核酸杂交以及免疫测定,从被分析的细胞群体或基因文库中,鉴定出真正是所需重组DNA分子的特定克隆过程

由于被筛选的大量的菌落和噬菌斑当中,仅有很少的比例含有期望的重组DNA分子,因此需要使用高度敏感和高度特异的筛选方法。;根据所使用克隆载体的特性不同,重组克隆的筛选方法也多种多样。比如,用噬菌体DNA作为载体时就不需要筛选,所有正常的噬菌斑都是重组体;当使用pUC系列载体时,白色菌落一般都是重组体;如果所用的质粒并不具备明显的鉴别特性,那么我们也可以利用DNA的酶切分析进行直接鉴定。比如,从平板上随机挑选10个菌落,然后提取其中的质粒DNA分子,并对其进行酶切分析,同样可以准确地选择得到所要的重组克隆,而且同时可以鉴定外源片段插入的方向,选择得到所要的理想克隆。

有时,我们不仅想知道哪些是重组体克隆,而且想知道重组体克隆中哪些是含有某个基因的克隆(比如在cDNA文库的筛选中,我们就需要选择到含有目的基因克隆)。这时我们可以用比较复杂的核酸杂交或免疫化学的方法。

;转化率的影像因素;遗传学选择法(geneticselection):主要是根据受体细胞接受了重组DNA分子后所发生的遗传表型变化直接选择重组体的方法。

抗药性、显色、营养缺陷等;一、抗药性标记及其插入失活选择法;pBR322;(1)四环素:;3.选择过程:;当使用pUC系列载体时,白色菌落一般都是重组体;

或用合适的内切酶切下插入片断,再用其它酶切这个片断,电泳后比较结果是否符合预计的结果。

筛选的两层含义:将携带有外源插入DNA片段的克隆挑选出来,将携带有外源插入片段的重组体挑选出来

(1)从重组克隆中提取质粒(或DNA)。

与一抗的特异性结合。

mRNA一旦与DNA杂交成RNA-DNA双链后就不能被核糖体翻译出蛋白质(转译被抑制)。

最好用单克隆抗体(monoclonalantibody)

TK+细胞能产生胸苷酸激酶,???以可以利用培养基中的胸苷(T)合成TTP,存活。

抑制细菌生长,但不杀死细菌。

出同源异型盒基因定点突变的ES细胞克隆,并得到含该突变的嵌合体小鼠

重组子:含有重组DNA分子的转化子成为重组子。

从宿主细胞中提取DNA(或质粒载体),再用探针杂交。

专门设计检测能同DNA特异结合的蛋白质因子。;(2)氨苄青霉素抗性插入失活选择过程;二、?-半乳糖苷酶显色反应选择法;假阳性:

如果插入的外源DNA正好是3的倍数或没有终止密码;(不破坏?肽)。;;利用插入的外源基因的表达产物特性进行直接选择。(只在特定条件下)。;小鼠的二氢叶酸还原酶(DHFR)对三甲氧苄二氨嘧啶(抑制大肠杆菌生长)有抗性。;利用有插入片段的重组载体的分子量比野生型载体分子量大。;二、酶切电泳筛选法;;;;不同克隆的酶切结果;筛选过程;用EcoRI和HindⅢ分别切割同一来源的染色体DNA,并进行克隆,在前者的克隆中筛选到A基因,但在后者的克隆中未筛选到A基因,请说明原因.

;三、PCR扩增检测法;1.核酸杂交;二、核酸杂交检测方法;;Southernblot筛选结果;(1)原位杂交筛选;;(2)R-环检测法;;2.Northernblotting;第五节免疫化学检测法;利用抗体作为“探针”来检测转入受体菌并且表达出相应的蛋白质的外源基因。;;2.放射性抗体检测法过程;3.Broome-Gilbert双位点检测法;;二、免疫沉淀检测法;2.优缺点;;三、酶联免疫吸附测定(ELISA);;2.ELISA检测的一般步骤;加入一抗,反应后冲洗掉未结合的抗体。;加入二抗,与一抗结合后再将未结合的二抗冲洗掉。二抗只识别一抗。;加入无色的底物,被二抗上所带的酶催化反应转变成有色物质(或发光)。;;在特殊的分光光度仪(酶标仪)上比色,打印出结果。;的局限性;临床检验常用的单抗;四、免疫印迹(westernblotting)法;②聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE):;;③蛋白质电泳的分子量标准;;④凝胶中的蛋白质染色:;直接染色电泳结果;(2)Westernblotting;Western装置;②Blotting;;1)先用一抗(待测蛋白的单克隆抗体)与

膜上的蛋白结合。;④结果;转译筛选法有两种:

杂交选择转译(hybridselectedtranslation,HART)

杂交抑制转译(hybridarreatedtranslation,HRT)。

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