增强子的特点及其作用机制.ppt

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增强子的特点及其作用机制;增强子的概念;增强子的远距离效应;无方向性;具有组织特异性;增强子必须与特定的蛋白质因子结合后才能发挥增强转录的作用;无物种和基因的特异性;有的增强子可以对外部信号产生反应;增强子的作用机制;增强子的作用机制模型;成环模型(Loopingmodel);对于珠蛋白基因簇的简介;HS5;为了克服由于结合过程中DNA弯曲和缠绕导致的能量损失,一般需要一种称为“构筑蛋白”的转录调控蛋白参与作用。如LEF-1和MHGI,它们是HMG蛋白(高迁移率族蛋白)家族中两类序列特异性的DNA弯曲蛋白(DNAbendingprotein)。它们能与DNA小沟结合,使DNA发生一定角度的弯曲,以增进ATF、Ets-1等因子与增强子上对应识别位点结合。假如各激活子之间的互相作用足以提供DNA变形所需的能量,“构筑蛋白”就不需参与形成增强体。;增强子成环作用的证据;成环机制在DNA持久长度不小于150bp或者50nm时很轻易自发形成,并且只需要较小的能量,不过当长度不不小于该值时,DNA近乎呈刚直状态,欲使其弯曲需要很大的能量。;

;生物化学兼容性

;空间构造的选择互相作用;绝缘;染色质环境

;滑动模型(trackingmodel);;运用ATP的染色质重建因子除了增进DNA结合因子与增强子之间的互相作用外,还能增进结合在增强子上的复合物沿染色质模板的追踪作用这是由于它们能引起特定核小体位置的变化(滑动),或核小体三维构造的变化,或两者兼有,它们都能变化染色质对核酶的敏感性。

局限性

假如是滑动模型,会消耗诸多能量,效率是低的。在进化中会受到选择的压力。;异化追踪模型(Facilitatedtrackingmodel);链接模型(Linkingmodel);Hs5Hs4Hs3Hs2Hs1;局限性;拓扑效应

;(2)增强子区有一段富含交替嘌呤和嘧啶的序列,位于没有核小体的区域,可以以负超螺旋的形式生成Z-DNA,也是DnaseⅠ敏感区

试验还证明缺失3个Z一DNA形成片段的SV40是不能存活的,而除去两个Z一DNA形成片段的增强子接到β-珠蛋白基因上也失去增强活性

(3)超敏感部位或其附近也许具有能从Z一DNA转变为B一DNA的次序,这种转换变化DNA螺旋中右手旋转的净数值,使它更易打开。这种效应可以沿着DNA螺旋传递很??距离,从而影响到RNA聚合酶起始转录处螺旋打开。

这些变化波及核小体构造的解体或重新划分,或使局部的超螺旋密度发生变化,这种构造的变化也许有助于转录复合物的形成。;目前有关增强子的作用机制尚无一种普遍接受的观点,已提出的多种机制都能解释某些现象,很也许增强子自身存在多种作用机制,在不一样的细胞环境下通过不一样的机制发挥作用。;拓展;增强子陷阱;Nature:颠覆增强子老式认知,揭示惊人稳定的远程关系;留待处理的问题

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