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北京市科学技术研究院

市级财政项目测试化验加工

委托合同书

项目名称:创新工程-预研-基于肿瘤新生抗原的新型免疫疗法在中晚期胰腺癌临床治疗中的应用研究

委托任务:血液及组织样品全外显子组文库的上机测序、免疫组库测序

委托单位:北京市理化分析测试中心

承担单位:北京橡鑫生物科技有限公司

承担任务负责人:楼峰

起止时间:2019年06月至2019年12月

北京市科学技术研究院

二〇一九年四月

填写说明

1.本合同书由北京市科学技术研究院(以下简称“市科研院”)科研开发处监制,适用于承担市科研院市级财政专项项目的院属单位以测试化验加工费形式支付给承担单位的检验、测试、化验及加工等费用的管理。

2.测试化验加工费是指申报单位由于自身技术、工艺和设备等条件限制,必须支付给外单位的检验、测试、设计、化验及加工等费用,不涉及资产和知识产权相关费用。

3.经费明细中不得列支测试化验加工费。

4.本合同书一式六份,双方签字、盖章后生效,双方各执三份。

分条目列明委托任务目标及考核指标,包括定性目标和定量目标

血液及组织样品全外显子组文库的上机测序、免疫组库测序

1、目标

对6对(共12个样本)进行全外显子组测序及包括新抗原预测在内的生信分析

对6对(共12个样本)进行T细胞表面受体(TCR))的βα链进行测序及生信分析

2、考核指标

乙方提供全外显子组及TCRβα链高通量测序的原始测序数据,全外显子组数据量10G,TCR测序数据量1G;

乙方提供全外显子组的包括肿瘤新生抗原预测在内的分析报告12份;提供TCRβα链分析报告12份。

二、任务内容(委托的检验、测试、设计、化验或加工内容具体明确,与目标相对应)

血液及组织样品全外显子组文库的上机测序、免疫组库测序

本项目拟对新鲜获取的肿瘤组织及癌旁对照组织采用Illumina测序平台对全外显子组文库的上机测序和免疫组库测序。

乙方自样本接收日起15个工作日内完成文库构建和高通量数据测序,并提交测序数据质控报告;自样本接收日起35个工作日完成基础生物信息分析并提交分析报告。在规定时间内提交文库质检报告及原始数据。

三、分阶段任务实施方案(分阶段任务实施按月或季度填写,不得超过所属项目的期限)

10xgenomics单细胞转录组3’端文库构建

第一阶段:(2019年7月-9月)

内容:完成6对(共12个)样本全外显子组文库的上机测序、免疫组库测序

验收方案:在规定时间内提交文库质检报告,项目完成后,乙方向甲方提供全部原始数据。乙方提供样本质检及文库质检报告;若文库质量不达标,乙方对文库进行问题追溯并给出解决方案

第二阶段:(2019年10月-11月)

内容:完成6对(共12个)样本全外显子组和免疫组库的生物信息学分析

验收方案:投标人向招标采购单位提供相关分析方法及结果纸质报告并进行PPT汇报。

四、成果及其提供形式、知识产权归属与管理(预期成果形式包括:基地/示范/联盟、培养创新性人才、培训教材、方法数据库、新方法、论文/专著、专利、技术标准、新产品、新工艺、新装置、竞争性项目、领导批示、国际性学术会议、其他;)

(一)成果及其提供形式

本合同项目结束后,乙方提供构建测序下机数据及纸质版生物信息学分析报告

(二)知识产权归属与管理

本合同成果的知识产权归甲方所有,若在此过程中产生争议,应通过平等、友好协商予以解决。

五、技术情报和资料的保密※

(1)保密内容和范围:甲、乙双方在协议执行期内的研究数据与成果,包括原始数据、分析报告、论文和专利以及与本项目相关的技术资料。

(2)乙方必须按照《政府采购合同》的要求从事项目研究与开发,研究开发的技术资料包括原始数据、分析报告、以及与本项目相关的技术资料全部转交甲方留存。

(3)乙方必须严格遵守保密制度,未经甲方允许,乙方不得将原始数据、分析报告、以及与本项目相关的技术资料公开发表和发布、亦不得向第三方泄漏以上内容。

六、委托任务费用及支付方式

1.委托任务经费不得列支测试化验加工费,其他支出明细按国家和北京市相关管理规定执行。

2.委托任务经费总额为人民币捌万陆仟肆佰元整(大写),即¥86,400.00。

3.委托任务经费明细见附件1。

4.支付方式

签订合同后7个工作日内,中标人向招标人支付合同金额5%的履约保证金,即人民币肆仟叁佰贰拾元整(¥4,320.00元);招标人向中标人支付合同金额70%的款项,即人民币陆万肆佰捌拾元整(¥60,480.00元);验收完成后7个工作日内,招标人向中标人支付合同金额30%的款项,即人民币贰万伍仟玖佰贰拾元整(¥25,920.00元);同时向中标人退还履约保证金。

七、合同书双方签章

甲方

单位名称

北京市理化分析测试中心

(单位公章)

2019

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