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埃博拉病毒核酸检测方法
一、目的
埃博拉病毒核酸的提取及PCR检测。
二、适用范围
适用于检测血标本中埃博拉病毒核酸。
三、实验前准备
核对被检样品,包括患者的姓名、编号及检测项目等。
四、检测仪器设备和材料
实时定量核酸扩增检测仪,常规核酸扩增检测仪,RNA提取
试剂盒,一步法RT-PCR扩增试剂盒,一步法实时定量RT-PCR扩
增试剂盒等。
五、实验步骤
(一)实验准备
1.埃博拉病毒相关感染性材料灭活要求在BSL-3级实验室
生物安全柜内操作,灭活材料的核酸提取可在BSL-2级实验室内
进行,核酸PCR扩增可在BSL-1级实验室内进行。
2.进入实验场所之前,要事先准备好所需试剂、样品。预约
实验场所。
(二)RNA的提取(两种方法,可选任一方法进行核酸提取)
RNA提取方法一(5.2.1~5.2.3)
使用TRIzol(或TriPure)试剂以及QIAampViralRNAMini
1
试剂盒提取血标本中病毒RNA。
1.试剂准备:
a.TRIzol(或TriPure)试剂避光保存于2-25℃。QIAamp
ViralRNAMini试剂盒室温(15~25℃)保存;
b.96~100%无水乙醇;
c.1.5ml离心管;
d.带滤芯的灭菌无RNase的移液枪头;
e.台式离心机(适用于1.5ml离心管的转头);
f.缓冲液AW1和AW2在第一次使用前要按照试剂盒说明书加
入适量无水乙醇稀释;
g.加入310μlAVE至冻干的CarrierRNA中,充分溶解后分
装保存于-20℃,每份分装保存的CarrierRNA不能冻融超过三次。
2.埃博拉病毒相关感染性标本灭活,应在BSL-3实验室Ⅱ级
生物安全柜内进行。
a.吸取700μlTRIzol(或TriPure)至带螺旋口的离心管中,
每管加入5.6μlCarrierRNA。
b.向上述的裂解液中加入70μl样品,盖好盖后,轻轻的上
下颠倒混匀10次,室温孵育不少于10分钟(为避免产生气溶胶,
不要使用震荡仪或摇动离心管混匀)。
c.将管浸入消毒液中3~5分钟,彻底消毒管外壁,然后擦干
净,简单离心使离心管顶端液体落到底部。如需将灭活样本转运
至BSL-2实验室进行病毒RNA提取,将样本裂解液转移至新管中,
颠倒10次以保证管内部充分灭活,然后将裂解样本管浸入消毒液
中3~5分钟,彻底消毒管外壁,然后擦干净,将裂解样本管放入防
2
漏保存装置中,可将管移出生物安全柜进行转运或冻存。6小时
内可在2~8℃保存,6小时以上至2周可在-20℃保存,超过2
周需在-80℃保存,应避免反复冻融。
3.RNA提取,可在BSL-2实验室内进行。
a.在裂解样本管内加入620μl96~100%的乙醇,轻轻的
上下颠倒混匀10次,再简单离心。
b.小心将700μl液体加入QIAampMiniSpinColumn中,盖
好盖,8000rpm/min离心1min,弃去收集管,将柱子置于一新的
2ml收集管上。
c.打开QIAampMiniSpinColumn的盖子,重复步骤5.2.3b,
直至完成全部样品离心。
d.打开盖子,向柱中加入500μlAW1缓冲液,盖好盖,
8000rpm/min离心1min,弃去收集管,将柱子置于一新的2ml收
集管上。
e.打开盖子,加入500μlAW2缓冲液,盖好盖,14000rpm/min
离心3min。
f.将柱子置于一新的2ml收集管上,空离1min。
g.将柱子置于一新的1.5ml离心管上,加入50μlAVE洗脱
缓冲液,室温孵育1min,8000rpm/min离心1min。离心液即为病
毒RNA
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