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埃博拉病毒核酸检测方法

一、目的

埃博拉病毒核酸的提取及PCR检测。

二、适用范围

适用于检测血标本中埃博拉病毒核酸。

三、实验前准备

核对被检样品,包括患者的姓名、编号及检测项目等。

四、检测仪器设备和材料

实时定量核酸扩增检测仪,常规核酸扩增检测仪,RNA提取

试剂盒,一步法RT-PCR扩增试剂盒,一步法实时定量RT-PCR扩

增试剂盒等。

五、实验步骤

(一)实验准备

1.埃博拉病毒相关感染性材料灭活要求在BSL-3级实验室

生物安全柜内操作,灭活材料的核酸提取可在BSL-2级实验室内

进行,核酸PCR扩增可在BSL-1级实验室内进行。

2.进入实验场所之前,要事先准备好所需试剂、样品。预约

实验场所。

(二)RNA的提取(两种方法,可选任一方法进行核酸提取)

RNA提取方法一(5.2.1~5.2.3)

使用TRIzol(或TriPure)试剂以及QIAampViralRNAMini

试剂盒提取血标本中病毒RNA。

1.试剂准备:

a.TRIzol(或TriPure)试剂避光保存于2-25℃。QIAamp

ViralRNAMini试剂盒室温(15~25℃)保存;

b.96~100%无水乙醇;

c.1.5ml离心管;

d.带滤芯的灭菌无RNase的移液枪头;

e.台式离心机(适用于1.5ml离心管的转头);

f.缓冲液AW1和AW2在第一次使用前要按照试剂盒说明书加

入适量无水乙醇稀释;

g.加入310μlAVE至冻干的CarrierRNA中,充分溶解后分

装保存于-20℃,每份分装保存的CarrierRNA不能冻融超过三次。

2.埃博拉病毒相关感染性标本灭活,应在BSL-3实验室Ⅱ级

生物安全柜内进行。

a.吸取700μlTRIzol(或TriPure)至带螺旋口的离心管中,

每管加入5.6μlCarrierRNA。

b.向上述的裂解液中加入70μl样品,盖好盖后,轻轻的上

下颠倒混匀10次,室温孵育不少于10分钟(为避免产生气溶胶,

不要使用震荡仪或摇动离心管混匀)。

c.将管浸入消毒液中3~5分钟,彻底消毒管外壁,然后擦干

净,简单离心使离心管顶端液体落到底部。如需将灭活样本转运

至BSL-2实验室进行病毒RNA提取,将样本裂解液转移至新管中,

颠倒10次以保证管内部充分灭活,然后将裂解样本管浸入消毒液

中3~5分钟,彻底消毒管外壁,然后擦干净,将裂解样本管放入防

漏保存装置中,可将管移出生物安全柜进行转运或冻存。6小时

内可在2~8℃保存,6小时以上至2周可在-20℃保存,超过2

周需在-80℃保存,应避免反复冻融。

3.RNA提取,可在BSL-2实验室内进行。

a.在裂解样本管内加入620μl96~100%的乙醇,轻轻的

上下颠倒混匀10次,再简单离心。

b.小心将700μl液体加入QIAampMiniSpinColumn中,盖

好盖,8000rpm/min离心1min,弃去收集管,将柱子置于一新的

2ml收集管上。

c.打开QIAampMiniSpinColumn的盖子,重复步骤5.2.3b,

直至完成全部样品离心。

d.打开盖子,向柱中加入500μlAW1缓冲液,盖好盖,

8000rpm/min离心1min,弃去收集管,将柱子置于一新的2ml收

集管上。

e.打开盖子,加入500μlAW2缓冲液,盖好盖,14000rpm/min

离心3min。

f.将柱子置于一新的2ml收集管上,空离1min。

g.将柱子置于一新的1.5ml离心管上,加入50μlAVE洗脱

缓冲液,室温孵育1min,8000rpm/min离心1min。离心液即为病

毒RNA

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