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DNMT3B基因启动子C46359T多态性与食管癌易感性的关联分析

DNMT3B基因启动子C46359T多态性与食管癌易感性的关联分析【摘要】目的：

探讨DNMT3B基因启动子C46359T单核苷酸多态性与江苏汉族人群食管癌易感性的关系。

方法：

提取195例食管癌患者及１89例健康体检人员外周血基因组DNA，采用PCRRFLP结合DNA测序技术检测DNMT3B基因启动子C46359T单核苷酸多态性。

结果：

正常对照DNMT3BC46359T等位基因TT/CT基因型频率为98.9%/1.1%,病例组为97.9%/2.1%，在对照组与病例组中均未检测到DNMT3B46359CC基因型。

携带DNMT3B46359CT等位基因的个体与对照组相比，其患食管癌的易感性未见明显升高(Ｐ=0.43,OR=1.96，95%CI：

0.35～10.82)。

对比江苏汉族人群和英国、美国白种人群，DNMT3BC46359T单核苷酸多态性频率分布有明显差异(Ｐlt;0.01)。

结论：

DNMT3B基因C46359T多态性可能不适合作为中国汉族人群食管癌易感性的一个独立风险因素，此位点多态性的分布在不同人种间有显著差异。

【关键词】DNA甲基转移酶3B食管癌单核苷酸多态性肿瘤的病因学，尤其是其与某些遗传性疾患关系的研究已表明,大多数人类恶性肿瘤是由环境因素作用于遗传物质的结果［1］，遗传因素越来越被认为是癌症发病风险的主要因素之一［23］。

尽管有些基因突变可以导致肿瘤，但是对于大多数人来说，患肿瘤的风险可能来自于相对常见的低外显率的疾病相关多态性的差异［3］。

肿瘤不仅是遗传性疾病，同时也是由基因转录沉默所引起的表观遗传性疾病。

在一些人类肿瘤细胞中，启动子区CpG岛的重新甲基化可能是肿瘤抑制基因失活的机制［4］。

DNA甲基化的异常是最常见的表观遗传学改变，DNA甲基化是由一组DNA甲基转移酶(DNAmethyltransferase，DNMT)家族催化的，目前在哺乳动物中确定的DNMT有DNMT1、DNMT3A和DNMT3B［57］。

其中，DNMT1主要负责维持甲基化，而DNMT3A和DNMT3B主要负责重新甲基化［6，8］。

DNMT3B在肿瘤形成过程中起重要作用，已经发现在肿瘤细胞中存在DNMT3B的高表达［5］。

DNMT3B基因定位于20号染色体q11.2，在距转录起始位点-149碱基对的启动子区含有CT转换多态性（C46359T），体外实验表明，该位点的转换可以使DNMT3B启动子的活性增加30%［9］。

食管癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，其发病率在发展中国家居第5位，我国的食管癌死亡率居世界首位［10］。

早期食管癌经手术切除后5年生存率可达90％以上，而中晚期患者仅为6％～15％［1112］。

如果能够做到早期诊断或易感风险评估，则有可能降低食管癌的死亡率。

本研究选择江苏地区汉族人群，探讨DNMT3B基因C46359T位点基因多态性与该地区人群食管癌遗传易感性之间的关联。

1材料和方法1.1材料病例组选自2007年2月～2007年7月在江苏省肿瘤医院、南京军区南京总医院保存的食管癌病人血液样本195例，其中男153例，女42例，所有病例临床资料完整。

血液标本采集前均未有抗肿瘤药物使用记录。

对照组为健康人血液样本189例，其中性别、年龄等均与病例组相匹配，男135例，女54例,见表1。

两组人群均系江苏地区汉族人群，个体之间均无血缘关系。

1.2方法1.2.1基因组DNA抽提采集静脉全血2ml，乙二胺四乙酸二钾(EDTAK2)抗凝，常规蛋白酶K消化后苯酚／氯仿抽提，乙醇沉淀法提取基因组DNA［6］，总共提取食管癌患者、健康正常人外周血DNA384例，提取的DNA溶解于pH8.0TE中，4℃保存。

表1病例组与对照组样本间年龄和性别分布频率比较例注：

括弧中为所占百分比1.2.2PCRPCR引物序列见文献［13］，上游5TGCTGT