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两起新型布尼亚病毒感染病例的病毒序列分析
目的:分析发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒感染(SFTSV)感染患者
的临床特点、流行病学以及SFTSV基因序列。方法:收集本市2014年4-6月某
医院送检的2例重症发热伴血小板减少(SFTS)患者的血清标本,经核酸荧光
PCR检测阳性确诊。对病毒核酸测序并与GenBank数据比对。结果:两名患者
均有典型的SFTSV感染的临床症状,以发热、腹泻为首发症状,血常规见粒系
及血小板呈进行性降低。从2例患者血清提取的核酸经测序,其基因序列与
GenBank中的SFTSV进行比对,0428株(安庆)的RNA多聚酶、糖蛋白、NS
蛋白的同源性与安徽代表株AHL/China/2011的同源性最高,均达到99%。0507
株(滁州)上述目的基因与江苏株JS2011-013-1的同源性高达99%。结论:SFTSV
在本地区散发存在,基因序列分析结果提示其来源或有差异。
發热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SevereFeverWithThrombocytopenia
SyndromeBunyavirus,SFTSV)是我国2010年新发现的布尼亚病毒科白蛉病毒
属的新病毒。SFTSV感染主要导致发热伴血小板减少综合征(severefeverwith
thrombocytopeniasyndrome,SFTS),引起以发热伴血小板、白细胞减少、严重
的胃肠道症状、浅表淋巴结肿大为主要特征的临床症状,是一种新发传染病,患
者可因多脏器功能衰竭而死亡,病死率较高。河南、湖北、山东、安徽、辽宁、
江苏等省均已出现该病病例[1-2]。新型布尼亚病毒可能为一种由蜱传播的自然疫
源性疾病[3-6],螨类、鼠类与人群发病之间应有一定的联系[7],但其在自然界
中的循环传播模式尚不完全清楚。江苏省丘陵地区总面积占全省总面积的15%,
造成江苏SFTSV流行的主要原因可能是因为其地貌特点[8]。2014年4-5月,两
名安徽患者就诊于南京某医院,笔者对其开展了流行病学调查和实验室病原学检
测,采用实时荧光定量RT-PCR及产物测序对布尼亚病毒核酸进行鉴定和分子进
化分析。1资料与方法
1.1流行病学资料2014年4-5月,南京某医院收治两名SFTS患者,均为
男性,年龄分别为62岁和77岁,来自安徽两个城市的不同乡村,职业均为农民,
居住地为丘陵或山区,均无疫区居留史,均无布尼亚病毒阳性患者接触史。蜱虫
叮咬史均不详。其中一名患者发病前两周有采茶经历,另一名患者发病前两周有
种地、割草史。
1.2临床特征2名患者均以发热、腹泻为首发症状。其中一名患者皮肤见瘀
点和瘀斑。
1.3实验室检查血常规见粒系及血小板呈进行性降低,其中WBC下降至
(0.88~1.47)×109/L,PLT最低为40×109/L,血液生物化学检测酶谱较高,包
括转氨酶、乳酸脱氢酶、肌酸激酶等均明显升高,肾功能损害,肌酐升高,低钙
血症。
1.4病原学检查从患者血清提取病毒核酸,使用台塑公司组织RNA全自动
萃取试剂盒提取RNA,按试剂盒说明书操作。实时荧光定量PCR检测:S-F:
GGGTCCCTGAAGGAGTTGTAAA,S-R:TGCCTTCACCAAGACTATCAATGT,
探针:FAM-TTCTGTCTTGCTGGCTCCGCGC(引物序列由江苏省疾控中心提
供)。PCR反应体系用QIAGEN公司的QuantiTect?ProbeRT-PCRKit(Cat.No
20443)试剂盒配制。扩增反应条件:反转录50℃30min;变性95℃5min;
95℃10s,60℃40s;扩增40个循环。标准模式为每个循环60℃40s时收
集荧光。Ct值≤37且有对数增长曲线的为扩增阳性,Ct值37且有对数增长曲线
需重复实验,仍有数增长曲线的为扩增阳性,无对数增长曲线的为扩增阴性。反
应在ABI7500fast荧光定量PCR仪上进行。分析软件为SDSv1.3.2。
1.5序列测定用参考文献[9-10]所述方法對布尼亚病毒基因组依赖RNA
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