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基因工程概论;4基因工程的操作过程;ADNA的体外重组(切与接);5;BamHI;BamHI;5;CTGCA3;C3;重组率=含有外源DNA的重组分子数/载体分子总数
在常规实验条件下,重组率一般为25-75%。
重组率是衡量连接反应效率的重要指标,较高的重组率可以
大大简化DNA重组的后续操作。;提高外源DNA片段与载体的分子比:5:1-10:1;加装同聚尾末端:;B重组DNA分子的转化和扩增(转与增);;;;革兰氏阳性细菌(如枯草杆菌、链霉菌等)接纳外源DNA的主要屏障是细胞壁,因而这类细菌通常采用原生质体(即细胞去壁后的形态)转化的方法转移质粒或重组DNA分子。;不同细菌的原生质体制备方法不尽相同,以链霉菌为例:细菌需生长在高渗培养基中(如34%的蔗糖溶液,并加入甘氨酸以增加细菌细胞壁对溶菌酶的敏感性。在制备过程中,菌体应始终悬浮在10.3%的蔗糖等渗溶液中。与原生质体接触的所;取0.2-1ml的原生质体悬浮液(108-109个原生质体),加入10-20mlDNA重组连接液,同时加入含有PEG1000和Ca2+的等渗溶液,混匀。;感受态细胞的培养:
将大肠杆菌在含有麦芽糖(不含葡萄糖)和MgCl2的培养基中培
养至OD600=0.5;
吸附:
加入经体外包装好的重组噬菌体悬浮液,30℃保温10分钟;
转染裂解:
加入20倍体积的新鲜培养基,30℃培养2小时,直至培养液菌
体裂解,培养液澄清度增加,然后涂板筛选。;将待转化的质粒或DNA重组连接液加入到电穿孔转化仪的样品池中,两极施加高压电场。在强大电场的作用下,细菌细胞壁和细胞膜产生缝隙,质粒或DNA重组分子便可进入细胞内。
电穿孔转化法操作简单,而且几乎对所有含细胞壁结构的受体细胞均有效,但转化效率差别很大。
同样的原理,电穿孔法也可用于质粒消除实验。;转化率是衡量转化效率的重要指标,其定义为:每微克载体DNA在最佳转化条件下进入受体细胞的分子数。由于在一般的转化实验规模中,每个受体细胞最多只能接受一个载体分子,因此转化率的定义也可以表征为:每微克载体DNA转化后,受体细胞接纳载体DNA的个数,即克隆数(在筛选时,未接纳载体或重组子的受体细胞不长);例如,pUC18对大肠杆菌的转化率为108,即每微克pUC18中只有108个分子能进入受体细胞。一微克pUC18共有3.4X1011个分子(6.02X1017/2686X660),也就是说,每3400个pUC18分子才有一个分子进入受体细胞。
另一方面,在实际操作过程中,转化一微克pUC18共需2ml感受态细胞,大约含有2X1010个大肠杆菌细胞,也就是说,每200个细胞只有一个细胞能接纳pUC18DNA。;利用转化率和重组率等参数可以帮助设计DNA重组实验规模。例;载体及DNA重组分子方面:;受体细胞方面:;转化方法方面:;转化细胞的扩增操作是指转化完成之后细胞的短时间培养。在实验时,扩增操作往往与转化操作偶联在一起,如:
Ca2+诱导转化后的37℃培养一个小时;
原生质体转化后的再生过程;
l噬菌体转染后的30℃培养等,均属扩增操作。;增殖转化细胞,使得有足够数量的转化细胞用于筛选程序;C转化子的筛选和鉴定(检);C转化子的筛选和鉴定(检);;抗药性筛选法的基本操作:;显色筛选法的基本原理:;显色筛选法的基本操作:;所谓的限制性酶切图谱法就是对载体上插入的外源DNA片段进行酶切图谱分析,并以此与目的基因的已知图谱对比,因此利用这种方法不仅能区分重组子与非重组子,而且还能鉴定目的重组子。但这种方法在用于数千规模的转化子筛选时,工作量极大,实验成本也高。;全酶解图谱法:;;菌落或噬菌斑原位杂交法的工作原理是根据克隆的目的基因或DNA片段的同源序列设计并合成探针,以此搜寻筛选含有目的基因的目的重组子。其中,DNA同源序列之间的特异性互补杂交是该技术的基本理论依据。;;杂交探针的标记:DNA聚合酶介导的缺刻前移标记;杂交探针的标记:地高辛系统标记;如果已知克隆的目标基因两侧的序列,便可合成引物,以待鉴定的重子DNA为模板,进行PCR扩增。能扩增出大小相符;淀粉酶目的基因的鉴定:;如果待筛选鉴定的目标蛋白既不能测定生物活性,又无现成的抗体使用,则可采用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行粗略的筛选。;4基因工程的操作过程
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