蛋白质组学大数据研究进展.docx

第35卷

第35卷第12期2023年12月

Vol.35,No.12Dec.,2023

ChineseBulletinofLifeSciences

DOI:10.13376/j.cbls/2023170

文章编号:1004-0374(2023)12-1561-09

朱云平,军事科学院军事医学研究院生命组学研究所研究员,博士生导师,国家蛋白质科学中心生物信息学实验室PI。曾任中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会副主任委员,863重大项目首席专家。研究方向为蛋白质组生物信息学、生物医学大数据挖掘。研发了蛋白质组信息学系列算法,建立的iProX是国际学术界公认的蛋白质组数据共享平台。发表SCI论文两百余篇;获软件著作权三十余项,中国发明专利5项。获中国电子信息科学技术奖一等奖、中国发明协会发明创新奖一等奖,以及国家科技进步创新团队奖、北京市科学技术奖一等奖、中华预防医学科技奖一等奖、军队教学成果一等奖等。

蛋白质组学大数据研究进展

刘祎1,2,3,朱云平2,3*

(1北京工业大学环境与生命学部,北京100124;2军事科学院军事医学研究院生命组学研究所,国家蛋白质科学中心(北京),北京102206;3北京蛋白质组研究中心,北京102206)

摘要:随着研究问题的深入和技术的发展,蛋白质组学研究逐渐迈向大数据时代。数据规模的扩大可以为研究人员发现更稳定可靠的结论提供坚实的基础,但也对数据的存储和分析等环节提出了更多的挑战。本文首先介绍了蛋白质组学数据的特点,然后主要从蛋白质组学大数据相关的数据库和分析方法两方面总结目前的研究进展,最后对该领域存在的挑战和机遇进行展望。

关键词:蛋白质组学;大数据;数据库;算法;软件

中图分类号:G250.74;Q81文献标志码:A

Advancesofbigdatainproteomics

LIUYi1,2,3,ZHUYun-Ping2,3*

(1FacultyofEnvironmentandLife,BeijingUniversityofTechnology,Beijing100124,China;2NationalCenterfor

ProteinSciences(Beijing),BeijingInstituteofLifeOmics,Beijing102206,China;3BeijingProteomeResearchCenter,

Beijing102206,China)

Abstract:Withtheadvanceofresearchtopicsanddevelopmentoftechnologies,proteomicsresearchisgraduallymovingtowardstheeraofbigdata.Theexpansionofdatascalecanprovideasolidfoundationforresearcherstofindmorestableandreliableconclusions,butitalsoposesmorechallengestodatastorageanddataanalysis.Inthispaperwefirstintroducethecharacteristicsofproteomicsdata,thensummarizethecurrentresearchprogressfromthetwoaspectsofproteomicsbigdata-relateddatabasesandanalysismethods,andfinallylookforwardtothechallengesandopportunitiesinthisfield.

Keywords:proteomics;bigdata;database;algorithm;software

收稿日期:2023-02-01;修回日期:2023-03-02

基金项目:国家重点研发计划(2021YFA1301603)*通信作者:E-mail:zhuyunping@

1562生命科学

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