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目录
摘要I
AbstractIII
1绪论1
1.1研究背景和意义1
1.1.1研究背景1
1.1.2研究意义2
1.2国内外研究现状3
1.2.1单细胞数据聚类方法5
1.2.2scRNA-seq数据插补方法7
1.3论文研究内容及结构9
1.3.1研究内容9
1.3.2论文贡献9
1.3.3论文结构10
2基于结构感知的自监督单细胞深度聚类网络11
2.1问题引入11
2.2scLGF模型12
2.2.1数据预处理模块13
2.2.2双维特征嵌入模块13
2.2.3局部与全局图结构融合模块14
2.2.4自监督聚类模块15
2.3实验结果与分析17
2.3.1数据集17
2.3.2评价指标17
2.3.3模型对比18
2.3.4消融实验20
2.3.5参数分析22
2.4本章小结23
3基于结构感知和左截断高斯混合的自监督单细胞深度聚类网络25
3.1问题引入25
3.2scDCSL模型26
3.2.1数据预处理模块26
3.2.2双源信息嵌入模块27
3.2.3局部与全局图结构融合模块29
3.2.4自监督聚类模块30
3.3实验结果与分析31
3.3.1数据集31
3.3.2模型对比32
3.3.3消融实验34
3.3.4参数分析35
3.4本章小结36
4基于结构感知的多组学单细胞数据聚类网络38
4.1问题引入38
4.2scMCS模型39
4.2.1数据预处理模块40
4.2.2信息嵌入融合模块40
4.2.3自监督聚类模块41
4.2.4双源信息冗余约减模块42
4.3实验结果与分析43
4.3.1数据集43
4.3.2模型对比44
4.3.3消融实验46
4.3.4参数分析46
4.4本章小结48
5总结与展望50
5.1论文总结50
5.2未来展望51
参考文献1
攻读学位期间取得的研究成果8
致谢9
摘要
单细胞测序技术在发现细胞异质性、探索细胞在发育期的分化过程以及挖掘同一细胞
群的细胞亚型方面取得了巨大成功，其重要目标之一是将不同种类的细胞归类为同质亚群，
使同一亚群中的细胞具有相同的类型或状态。聚类是一种非常适合解决这一问题的方法。
目前，针对单细胞的聚类研究方法不断被提出，性能得到巨大提升。深度学习也因其强大
的学习能力被广泛用于单细胞数据的聚类分析中，常见
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