基于序列的病毒宿主蛋白蛋白相互作用预测.docx

下载文档

1
0
约1.39万字
约 13页
2025-01-02 发布于河北
举报
版权申诉
保障服务

基于序列的病毒宿主蛋白蛋白相互作用预测.docx

1、本文档共13页，其中可免费阅读4页，需付费200金币后方可阅读剩余内容。
2、本文档内容版权归属内容提供方，所产生的收益全部归内容提供方所有。如果您对本文有版权争议，可选择认领，认领后既往收益都归您。
3、本文档由用户上传，本站不保证质量和数量令人满意，可能有诸多瑕疵，付费之前，请仔细先通过免费阅读内容等途径辨别内容交易风险。如存在严重挂羊头卖狗肉之情形，可联系本站下载客服投诉处理。
4、文档侵权举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。

PAGE4

摘要

蛋白质序列决定蛋白质的结构和功能，氨基酸序列决定蛋白质之间的作用。本研究基于蛋白质序列，通过机器学习算法对病毒与宿主蛋白质之间的相互作用进行了预测。从VirHostnet数据库中得到29945条病毒-宿主蛋白质相互作用数据，作为阳性样本，通过随机匹配产生阴性样本。使用了两种特征编码算法（氨基酸组成AAC和局部描述符CTDC）,进行了特征选择、聚类、降维、特征归一化四种特征分析方法，通过5折交叉验证和独立测试比较以两种特征编码算法构建的模型，发现仅以氨基酸组成构建的随机森林模型和整合支持向量机和随机森林的集成学习模型预测效果最好，AUC值均为0.89,结果表