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百学须先立志。——朱熹
手把手教你荧光定量PCR(一)
之前医学方小编教过大家如何在线利用NCBIprimerblast设计荧
光定量PCR引物,那么当我们有了引物,如何利用荧光定量PCR实验
来检测mRNA水平呢?今天小编先教给大家Real—timePCR最重要
的第一步,如何抽提高质量的RNA?
首先简单介绍一下实验中所用化学试剂耗材清单和作用,做到实
验时心中有数。
实验材料
Trizol
氯仿
异丙醇
无水乙醇
DEPC水(焦磷酸二乙酯)
Randomprimer
逆转录酶(AMV)及其buffer
RNaseinhibitor
新的没有用过的枪头
384孔板(透明)
DVD光盘(刻录拷贝数据)
八连PCR管
SYBRMasterMix
吾日三省乎吾身。为人谋而不忠乎?与朋友交而不信乎?传不习乎?——《论语》
实验试剂作用
01
Trizol主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,则其主要作用是裂解细胞、
抑制RNAse活性和蛋白质变性
2
氯仿作用(1)变性蛋白,(2)抽取苯酚,促进水相和有机相分
离;(3)去除脂溶性物质如油脂。配合的异戊醇的作用是消泡。
三层:上清RNA苯酚氯仿DNA下层蛋白质
3
异丙醇作用:破坏核酸的氢键而促进其从水相中沉淀,配合使用
的醋酸铵等盐则中和核酸负电荷,加速核酸聚积沉淀。
4
75%乙醇的作用是去除异丙醇和其它盐分。
5
DEPC水(焦磷酸二乙酯)是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。
它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而
抑制酶的活性。
RNA抽提步骤
在所有RNA实验中,最关键的因素是得到全长的RNA。实验失
人人好公,则天下太平;人人营私,则天下大乱。——刘鹗
败的主要原因是RNA酶的污染。RNA酶可耐受多种处理而不被灭活,
如煮沸、高压灭菌等。RNA酶最主要的潜在污染源是研究人员的手。
因此操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。
低温下操作
第一步:抽提RNA
1
最大起始量107个细胞,六孔板每孔加入Trizol1ml,充分混匀
裂解细胞,吹打至无粘稠(室温静置15min充分裂解)。
2
混匀,加入267ul氯仿(按照氯仿与Trizol体积比
200ul/0.75ml),充分震荡混匀,冰上3min。
3
12000g,15min,4℃。
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