《探秘人类基因组学》课件.pptVIP

探秘人类基因组学揭示生命密码，探索基因奥秘

课程概述基因组学基础定义、结构、组成要素人类基因组计划历史、目标、成果测序技术与应用原理、发展、医学应用伦理与未来

第一部分：基因组学基础1基因组概念生物体全部遗传信息的总和2DNA结构双螺旋结构，碱基配对规则3中心法则DNA→RNA→蛋白质的信息流4研究分支

什么是基因组？定义生物体内全部遗传物质的总和位置主要存在于细胞核染色体中功能包含构建和维持生物体的全部遗传指令特点

基因组的组成基因编码蛋白质或RNA的DNA片段调控元件控制基因表达的DNA序列重复序列多次重复出现的DNA片段非编码区不转录为RNA的DNA区域

DNA结构回顾双螺旋结构两条互补链缠绕形成右手螺旋，直径约2纳米碱基配对腺嘌呤(A)配对胸腺嘧啶(T)鸟嘌呤(G)配对胞嘧啶(C)物理特性磷酸糖骨架碱基通过氢键连接

中心法则：DNA→RNA→蛋白质DNA遗传信息的储存转录DNA→RNA，在细胞核中进行RNA信息的中间载体翻译RNA→蛋白质，在核糖体上进行蛋白质执行生物功能

基因组学的定义概念研究生物体基因组的结构、功能、进化和编辑的学科研究对象各种生物的基因组及其中所含的全部基因特点大数据、高通量、系统性、整体性方法测序、生物信息学分析、功能验证实验

基因组学的研究内容应用医学、农业、环境等领域应用功能基因表达、调控和互作变异多态性、突变与进化结构序列、组织与构架

基因组学的分支结构基因组学研究基因组的物理结构功能基因组学研究基因的功能与表达比较基因组学比较不同物种基因组医学基因组学研究疾病相关基因进化基因组学探究基因组演化过程

第二部分：人类基因组计划1启动阶段1990年正式启动2初步完成2000年宣布完成草图3全面完成2003年宣布基本完成4完善阶段2022年宣布完整人类基因组测序

人类基因组计划简介国际合作20多个国家参与的大科学计划目标测定完整人类基因组序列周期1990年启动，2003年基本完成投资耗资约30亿美元

人类基因组计划的目标绘制人类基因组图谱确定全部基因位置测定完整DNA序列解读30亿个碱基对建立基因组数据库公开共享测序数据开发分析工具创建生物信息学方法

人类基因组计划的历程1984构想提出美国科学家提出测序人类基因组的想法1990正式启动美国能源部和国立卫生研究院联合启动2000草图完成公布人类基因组工作草图2003基本完成宣布完成计划主要目标

人类基因组计划的主要成果基因组序列测定约30亿个碱基对的完整序列基因注释发现约2万个蛋白质编码基因变异图谱识别数百万个遗传变异位点技术发展推动测序技术快速进步

人类基因组的特点基因密度低只有约1.5%的序列编码蛋白质基因分布不均重复序列多超过50%为重复序列包括转座子、简单重复等个体差异小人与人基因组序列相似度99.9%差异主要为单核苷酸多态性

人类基因组的大小

人类基因组的基因数量~20,000蛋白质编码基因数量远少于最初预期的10万个~22,000非编码RNA基因包括转运RNA、核糖体RNA等~14,000假基因失去功能的基因残余

人类基因组的重复序列长散在重复序列长端重复序列短散在重复序列简单重复序列卫星DNA非重复序列

第三部分：基因组测序技术第一代测序Sanger法，读长长但通量低第二代测序高通量平行测序，读长短第三代测序单分子实时测序，读长超长未来发展纳米孔测序，成本更低，速度更快

基因组测序的原理DNA分离提取纯化目标DNADNA片段化将长DNA切成可测序片段测序反应确定DNA片段的碱基顺序数据分析使用生物信息学方法拼接序列

第一代测序技术Sanger测序法1977年发明，人类基因组计划主要使用链终止原理使用双脱氧核苷酸终止DNA合成电泳分离根据DNA片段长度分离荧光检测使用荧光标记识别不同碱基

第二代测序技术大规模并行同时测序数百万DNA片段桥式PCR在固相载体上扩增DNA合成测序边合成边测序，实时检测信号成本优势大幅降低测序成本，千美元基因组

第三代测序技术单分子实时测序直接测定单个DNA分子不需要PCR扩增纳米孔测序DNA通过纳米孔时改变电流可便携，实时分析主要优势超长读长(10-100kb)检测DNA修饰

测序技术的比较特点第一代第二代第三代读长700-900bp50-300bp10-100kb通量低高中准确率99.9%99.9%85-99%成本高低中时间慢快最快

基因组组装读段获取获得大量重叠的短DNA片段序列比对根据重叠区确定读段相对位置拼接算法使用计算机算法将读段拼接组装验证验证组装结果的准确性

基因组注释基因识别定位编码区和非编码区功能预测预测基因产物的功能结构注释确定基因的起始、终止和外显子结构调控元件识别启动子和其他调控序列

第四部分：人类基因组的结构功能单位基因及调控元件结构单位核小体、染色质组织单位染色体整体基