原核链特异性转录组合同模板-20160423.docVIP

原核链特异性转录组合同模板-20160423.doc

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合同号:BZ2016XXXXXXX

技术服务合同

项目名称:原核链特异性转录组测序及分析项目

委托方(甲方):

受托方(乙方):上海凌恩生物科技有限公司

签订地点:中国上海市

签订日期:2016年05月22日

有效期限:2016年05月22日至2017年05月21日

技术服务合同

委托方(甲方):

项目联系人:

通讯地址:

电话:

电子信箱:

受托方(乙方):

上海凌恩生物科技有限公司

项目联系人:

联系方式:

通讯地址:

上海市嘉定工业区兴贤路1180号7幢315室

电话:

021

传真:

021

电子信箱:

ngs@

依据《中华人民共和国合同法》的规定,合同双方就乙方为甲方提供“原核链特异性转录组测序与分析服务”事宜,经友好协商,签订本合同。

服务内容

样品测序前质检

样品来源:

乙方对甲方提供的样品进行检测,(如果甲方需要RNA抽提,该处加入RNA抽提过程),样品质检标准见附件一;

如果样品不满足质检要求,乙方会根据经验以邮件的方式提供给甲方建议,由甲方最终邮件确认是否继续实验或者重新提供样品,乙方对于不满足质检要求的样品不承担责任。

参考基因组有/无;其链接:

建库与测序

样品检测合格后,乙方基于IlluminaHiSeq测序平台,对每个样品构建转录组文库,并上机获得测序数据。

样品数量:N个

每个样品的数据量:NGb

技术服务的方式

最终以项目结题报告和测序原始数据作为服务验收的标志。

分析服务清单

具体分析内容

备注

标准分析

原始测序数据说明

原始测序数据质控

去核糖体污染

与参考基因组比对

比对结果可视化

测序饱和度分析

基因覆盖度分析

基因表达水平统计

样品表达的聚类

表达差异分析

差异基因GO注释

差异基因KEGG注释

差异基因富集分析

差异基因GO富集分析

差异基因GO富集DAG图

差异基因KEGG富集分析

差异基因表达模式聚类

新转录本预测与注释

反义转录本预测

操纵子分析

sRNA预测

变异分析

Promoter预测

定制化信息分析

该处分析内容可以由甲方与乙方共同协商后填写,属于该合同个性化定制的分析内容。

售后服务

甲方可以在分析完成日后的三个月内对原有数据、结果和分析方法等方面的疑问咨询乙方。

服务周期

完成本合同中所承诺的技术服务内容所需要的期限为:40个工作日,具体分解如下:

RNA抽提:如果甲方提供组织样品,乙方需要在3个工作日内完成RNA抽提工作,并将质检报告发送给甲方。

RNA质检:2个工作日完成RNA质检工作,将质检报告发送给甲方。

文库构建:待甲方确认RNA质量后,乙方需要在5个工作日完成文库构建工作。

IlluminaHiSeq测序:文库构建成功后,乙方需在15个工作日内完成测序工作。

生物信息学分析:乙方在测序工作完成后15个工作日完成本合同承诺的生物信息分析工作,并将结果以结题报告的形式交付甲方。

如因为甲方样品经乙方检测不符合实验要求,乙方有义务及时将信息反馈给甲方,待甲方重新送样检测合格

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