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验证报告:依据“农村学生营养改善计划”数据进行营养不
良多基因风险评分计算及验证
1研究目标
利用国家财政项目“农村学生营养改善计划”农村学生的学生营养健康状况监测数
据进行数据库清理、整理,对营养状况指标和营养状况缺乏基因风险指标进行方差分析、
非参数检验及相关性分析,研究营养状况指标与营养状况缺乏基因风险指标的关系,为
个性化营养指导提供依据。
2研究方法
2.1人群数据来源
人群数据来源于国家财政项目疾控中心营养所“农村学生营养改善计划”。该项-
11301-9
目对来自我国七个不同省份的名年级的中小学生进行了研究,研究中男女学
生数量基本各半。
2.2数据清洗
12.2
异常值的处理同“报告依据营养包队列数据建立营养评分算法及其验证”中
异常值的处理方法。
2.3检测指标
对参与国家财政项目-疾控中心营养所“农村学生营养改善计划”项目的1130名学
生进行血液采集,分离血清,进行血清中营养素指标检测,检测指标包括叶酸和维生素
B含量;另外对离心后分离的血细胞沉淀进行DNA提取及单核苷酸基因多态性(SNP)
12
1
检测,检测位点包括叶酸缺乏风险基因位点MTHFR:rs1801133、rs1801131、MTRR:
rs1801394;维生素B缺乏风险基因位点:FUT2:rs602662、FUT2:rs492602。
12
表1检测指标
营养状况指标营养缺乏风险SNP指标
MTHFR:rs1801133
叶酸MTHFR:rs1801131
MTRR:rs1801394
FUT2:rs602662
维生素B12
FUT2:rs492602
2.4营养不良多基因风险评分原理、公式
2.4.1原理
研究显示SNP影响人体营养素水平,但营养不良通常不是由于单个SNP位点的变
PRS
化引起的,目前多采用多基因风险评分()法进行遗传风险分析。本团体标准中采
PRS
用营养不良多基因风险评分估计个体出现营养不良的风险。的计算方法较多,包括:
简单相加遗传风险评分;以OR值作为权重的遗传风险评分;直接基于logistic回归的
OR
多基因遗传风险评分等。以值作为权重的遗传风险评分被广泛应用于疾病风险预测
研究中,但是对于营养素水平的研究相对较少,本标准中采用简单相加遗传风险评分进
行单项指标的营养不良风险评估,各单项指标的分值之和进行个体营养不良基因风险评
估。
2.4.2公式
PRSΣRA/2n
()
RA—单个营养素各SNP位点风险等位基因数量之和。
n—单个营养素SNP位点个数。
2.5营养不良多基因风险评分结果的判断
2
个体营养不良多基因风险评分与个体营养状况的关系需进行判断,针对现有人群的
检测指标(血清叶酸、维生素B)及对应的SNP检测位点(MTHFR:rs1801133、rs1801131、
12
MTRR:rs1801394;FUT2:rs602662、FUT2:rs492602)进行单项营养素缺乏风险预测验
证。由于尚无完整的各营养素指标(
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