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这类蛋白质的DNA结合结构域实际是以碱性区和亮氨酸拉链结构域整体作为基础的。第126页,共166页,星期日,2025年,2月5日定义:出现在DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元(motif)。当来自同一个或不同多肽链的两个α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸残基)相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。第127页,共166页,星期日,2025年,2月5日D.碱性-螺旋-环-螺旋第128页,共166页,星期日,2025年,2月5日bHLH蛋白的DNA结合能力分析第129页,共166页,星期日,2025年,2月5日E.同源域蛋白编码60个保守氨基酸序列的DNA片段具有转录调节功能:类似于HTH,主要与大沟结合第130页,共166页,星期日,2025年,2月5日第131页,共166页,星期日,2025年,2月5日第132页,共166页,星期日,2025年,2月5日(2)转录活化结构域转录激活结构域(transcriptionactivationdomains)一般由20-100个氨基酸残基组成。如GAL4分子中有2个这种结构域,分别位于多肽链的第147-196位和第768-881位;GCN4的转录激活结构域位于多肽链的第106-125位。第133页,共166页,星期日,2025年,2月5日a.酸性α-螺旋(acidicα-helix)
该结构域含有由酸性氨基酸残基组成的保守序列,多呈带负电荷的亲脂性α-螺旋,包含这种结构域的转录因子有GAL4、GCN4、糖皮质激素受体和AP-1/Jun等。增加激活区的负电荷数能提高激活转录的水平。可能是通过非特异性的相互作用与转录起始复合物上的TFIID等因子结合生成稳定的转录复合物而促进转录。第134页,共166页,星期日,2025年,2月5日第94页,共166页,星期日,2025年,2月5日5组蛋白乙酰化及去乙酰化对基因表达影响组蛋白N端尾巴上的赖氨酸的乙酰化中和了组蛋白尾巴的正电荷,降低了它与DNA的亲和性,导致核小体构象变化,利于转录调节蛋白质和染色质构象的变化,提高基因转录活性。乙酰化抑制了核小体的浓缩第95页,共166页,星期日,2025年,2月5日三种类型的修饰影响染色质五、染色质结构与基因表达调控第96页,共166页,星期日,2025年,2月5日按功能状态的不同可将染色质分为活性染色质和非活性染色质,所谓活性染色质是指具有转录活性的染色质;非活性染色质是指没有转录活性的染色质。活性染色质由于核小体构型发生构象的改变,往往具有疏松的染色质结构从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA聚合酶在转录模板上滑动。(一)活性染色质定义第97页,共166页,星期日,2025年,2月5日真核细胞中基因转录的模板是染色质而不是裸露的DNA,因此染色质呈疏松或紧密结构,即是否处于活化状态是决定RNA聚合酶能否有效行使转录功能的关键。第98页,共166页,星期日,2025年,2月5日第99页,共166页,星期日,2025年,2月5日(二)活性染色质的主要特点在结构上:活性染色质上具有DNaseI超敏感位点活性染色质上具有基因座控制区活性染色质上具有核基质结合区(MAR序列)第100页,共166页,星期日,2025年,2月5日每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5′端启动子区域,一般在50-200bp之间。超敏感位点的存在对基因表达是必需的。例在鸡β-珠蛋白基因簇中,胚胎时期的超敏感点只出现在胚胎型基因里;成体时期超敏感点出现在成体型基因里而不是胚胎型基因的5′端。1、DNAaseI超敏感位点第101页,共166页,星期日,2025年,2月5日染色体DNA上一种顺式作用元件,结构域中含有多种反式作用因子的结合序列,可能参与蛋白质因子的协同作用,使启动子处于无组蛋白状态。2、基因座控制区第102页,共166页,星期日,2025年,2月5日MAR一般位于DNA放射环或活性转录基因的两端。在外源基因两端接上MAR,可增加基因表达水平倍以10上,说明MAR在基因表达调控中有作用。是一种新的基因调控元件。3、核基质结合区(MAR)第103页,共166页,星期日,2025年,2月5日(三)活性染色体结构变化1.对核酸酶敏感活化基因常有超敏位点,位于调节蛋白结合位点附近。第104页,共166页,星期日,2025年,2月5日2.DNA拓扑结构变化天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在;基因活化后RNA-pol正超螺旋负超螺旋转录方向3.DNA碱基修饰变化真核DNA约有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范围与基因表达程度
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