基于GEO数据库的不完全射频消融后肝细胞癌关键基因的生物信息学研究.pdfVIP

12岭南现代临床外科2025年2月第25卷第1期LingnanModernClinicsinSurgery，February.2025，Vol.25No.1

基于GEO数据库的不完全射频消融后肝细

胞癌关键基因的生物信息学研究

张舟，黄碧，赵慧英*

［摘要］目的本研究旨在通过比较不完全射频消融（IRFA）处理肝细胞癌（HCC）患者与HCC的

基因表达谱，识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因，并提供潜在治疗靶点。方法从GEO

数据库中下载GSE212604数据集，根据是否接受IRFA治疗分为IRFA组和对照组，分析筛选出差

异表达基因。利用功能通路富集分析（GO、KEGG）挖掘潜在的关键生物学功能和信号通路。同

时下载GSE186280数据集，通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建HCC的共表达基因模

块，筛选关键模块中的核心基因。结果共鉴定出263个差异表达基因，其中上调基因179个，

下调基因84个。GO和KEGG分析显示，这些基因主要富集于代谢重塑、细胞骨架调控、免疫调

节和神经相关机制。此外，WGCNA分析发现与IRFA后HCC密切相关的基因模块，进一步筛选

出15个核心基因，包括LOC112268313、RNA5‐8SN3等。结论本研究通过生物信息学分析识别

了与IRFA处理HCC相关的关键基因，表明免疫信号和p53、PPAR等通路可能在其发生和进展中

发挥重要作用。这些关键基因和信号通路有望成为肝HCC治疗和诊断的新靶点。

［关键词］肝细胞癌；不完全射频消融；差异表达基因；加权基因共表达网络分析

doi：10.3969/j.issn.1009‐976X.2025.01.003中图分类号：R735.7文献标识码：A

Bioinformaticsofkeygenesinhepatocellularcarcinomaafterincompleteradiofrequencyablation

usingtheGEOdatabase

ZHANGZhou，HUANGBi，ZHAOHui⁃ying

BasicandtranslationalmedicineResearchCenterofSunYat⁃senMemorialHospital，SunYat⁃senUniver⁃

sity，Guangzhou，510120，China

Correspondingauthor：ZhaoHui⁃yin，zhaohy8@mail.sysu.edu.cn

［Abstract］ObjectiveTheaimofthisstudywastoidentifydifferentiallyexpressedgenesassociated

withIRFA‐treatedHCCandtoprovidepotentialtherapeutictargetsbycomparingthegeneexpressionpro‐

filesofhepatocellularcarcinoma（HCC）patientsafterincompleteradiofrequencyablation（IRFA）with

thoseofHCC.MethodsTheGSE212604datasetwasdownloadedfromtheGEOdatabaseanddivided

intoIRFAandcontrolgroupsaccordingtowhethertheyreceivedIRFAtreatmentornot，andanalysed

andscreenedfordifferentiallyexpressedgenes.Potentialkeybiologicalfunctionsandpathwayswereiden‐

tifiedusing