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心动周期条件生成心脏运动
ShaharZuler,GalLifshitz,HadarAverbuch-Elor,andDanRaviv
TelAvivUniversity,TelAviv,Israel
本
译
中
1图1.从输入终点收缩末期(ES)到完全注释的合成样本:给定一个输入的ES帧,我们
v的框架生成相应的舒张末期(ED)帧,以及对应的密集3D真实流场。我们的模型为心
4
9脏CT创建了完全标注的合成样本,解决了该领域缺乏标注数据的问题。注意:要查看
8此交互式动画,请使用AdobeAcrobat打开以实现输入ES与生成的ED之间的渐变
5
1过渡。
.
7
0
5摘要准确的心脏计算机断层扫描(CT)成像中的运动估计对于评估心脏
2
:功能和手术规划至关重要。数据驱动的方法已成为密集运动估计的标准方
v法,但它们依赖于大量带有密集真实值(GT)运动标注的数据,这些数据
i
x往往难以获得。为了解决这一限制,我们提出了一种新方法,该方法合成
r
a看起来逼真的心脏CT帧对,并附带密集的3D流场标注。
我们的方法利用了一个条件变分自编码器(CVAE),该编码器包含一种新
颖的多尺度特征条件机制,并经过训练以生成基于单个CT帧的3D流场。
通过将生成的流场应用于给定帧的变形,我们创建了模拟整个心动周期中
心肌变形的一对帧。这些帧对作为完全标注的数据样本,提供光学流真值
注释。我们的数据生成管道能够支持更复杂和精确的心肌运动模型的训练
和验证,从而大大减少对手动注释的依赖。
我们的代码、生成的动画样本及额外材料可在我们的项目页面获取:https:
//shaharzuler.github.io/GenerativeCardiacMotion_Page。
Keywords:合成数据生成·心动周期·条件VAE·光流·深度神
经网络
2S.Zuleretal.
1介绍
心血管疾病仍然是全球主要的致病原因,这突显了准确的心脏成像和运
动分析对于有效诊断、治疗计划、患者管理和手术干预的需求。CT扫描提
供了心脏结构和功能在心动周期不同阶段的非侵入性三维可视化,为心肌运
动提供了关键见解。因此,在对应的CT扫描之间进行运动估计已成为生物
医学成像中的一个关键任务,推动了开发数据驱动模型以捕捉心脏运动复杂
性的进展。
虽然其他成像方式,如超声(US)和磁共振成像(MRI),提供了一些
自动运动估计功能,但它们受到诸如平面感知、操作员依赖性、较低的图像
质量(US)和不足的层面分辨率(MRI)等限制。
深度学习通过专门的架构[7]、结合先验和约束条件[16,31,14]以及各种
其他建模心肌运动的方法显著推进了心脏运动估计的发展[9,27]。然而,缺
乏密集的心脏CT光流注释仍然是一个主要挑战。一些研究集中在无监督学
习上以绕过这一限制,但即使这些模型也需要标注数据集进行验证,使得缺
乏真实值成为训练和评估的主要障碍。另一种方法涉及手工合成的数据集,
它们使用先验知识来模拟[20,2]或基于心脏运动动态变形[30]体素位置。然
而,这类方法往往无法捕捉到细微
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