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东方粘虫颗粒体病毒与斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组全序列深度剖析与比较研究

一、引言

1.1研究背景与意义

在全球农业生产中，害虫的侵袭一直是制约农作物产量与质量的关键因素。东方粘虫（Mythimnaseparata）和斜纹夜蛾（Spodopteralitura）作为两种极具破坏力的农业害虫，给农业经济造成了巨大损失。东方粘虫属鳞翅目夜蛾科，是一种具有远距离迁飞能力的害虫，其幼虫具有多食性、暴食性、迁移性等特点，主要寄生于麦、稻、粟、玉米等禾谷类粮食作物及棉花、豆类、蔬菜等16科104种以上植物，大发生时可将作物叶片全部食光，严重影响作物生长与收成。2012年，中国的粘虫发生面积近5000万亩，严重发生面积650万亩，对粮食安全构成严重威胁。斜纹夜蛾同样隶属鳞翅目夜蛾科，是世界性分布的暴食性害虫，为害十字花科、茄科、葫芦科、豆科及粮、棉等99科290多种农作物。在长江中下游地区，自20世纪90年代以来，斜纹夜蛾几乎连年暴发成灾，已成为十字花科蔬菜、城市绿化地花草的最主要害虫之一，在桑树上的间歇暴发为害也严重影响了蚕桑生产。

长期以来，化学药剂一直是防治这些害虫的主要手段。但随着化学农药的大量、不合理使用，一系列问题逐渐凸显。一方面，害虫的抗药性不断增强，使得化学防治的效果逐渐降低，为达到相同的防治效果，不得不增加农药使用量和使用频率，进一步加剧了环境污染和生态破坏。另一方面，化学农药的残留问题对人类健康和生态环境产生了潜在威胁，在桑树上使用农药防治斜纹夜蛾时，还易引起家蚕中毒，造成减产。

相比之下，利用昆虫病毒进行生物防治具有诸多优势。昆虫病毒具有高度的宿主特异性，仅对特定的害虫种群起作用，对非靶标生物安全，有利于保护生态平衡。害虫对病毒不易产生抗药性，且病毒能在环境中积累，在害虫种群中形成流行病，从而长期有效地控制害虫虫口密度，具有显著的经济和生态效益，是目前较为理想且具有广阔发展前景的生物杀虫剂。东方粘虫颗粒体病毒（Mythimnaseparatagranulovirus，MsGV）和斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ（SpodopteralituranucleopolyhedrovirusⅡ，SpltNPVⅡ）分别是针对东方粘虫和斜纹夜蛾的特异性病毒，在害虫生物防治中具有重要的应用价值。

基因组全序列分析是深入了解病毒生物学特性、致病机制以及开发高效生物防治策略的基础。通过对MsGV和SpltNPVⅡ的基因组全序列测定与分析，可以精准地揭示病毒的基因组成、基因结构以及基因功能，为病毒的分类和进化研究提供关键依据，从分子层面解析病毒与宿主之间的相互作用机制，进一步明确病毒的致病过程，有助于针对性地优化生物防治方案，提高防治效果。对病毒基因组中与病毒复制、传播、毒力等相关基因的深入研究，还能为新型生物杀虫剂的研发和改良提供理论指导，促进开发更加高效、安全、环保的生物防治产品，推动农业害虫生物防治技术的创新与发展，为保障农业生产的可持续性和生态环境的健康稳定提供有力支持。

1.2研究目的与内容

本研究旨在通过对东方粘虫颗粒体病毒（MsGV）和斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ（SpltNPVⅡ）的基因组全序列进行测定与分析，深入了解这两种病毒的基因组结构、基因组成、基因功能以及进化关系，为其在农业害虫生物防治中的应用提供坚实的理论基础。具体研究内容如下：

MsGV和SpltNPVⅡ基因组全序列的测定：运用先进的高通量测序技术，对MsGV和SpltNPVⅡ的基因组进行测序。在测序过程中，严格把控测序质量，确保获得高质量的测序数据。随后，采用专业的生物信息学软件和算法，对测序数据进行拼接与组装，从而获得完整的MsGV和SpltNPVⅡ基因组全序列。

基因组特征分析：对测定得到的MsGV和SpltNPVⅡ基因组全序列进行全面的特征分析。详细确定基因组的大小、核酸组成以及GC含量等基本特征。通过生物信息学工具，精确预测基因组中的开放阅读框（ORFs），并对其进行细致的注释，包括基因的功能、结构域以及可能参与的生物学过程等。同时，深入分析基因的排列顺序和基因间隔区的特点，以揭示病毒基因组的组织规律。

功能基因分析：对MsGV和SpltNPVⅡ基因组中的功能基因进行深入研究。重点关注与病毒复制、转录、翻译、装配、传播以及毒力等过程密切相关的基因。通过序列比对、同源性分析以及功能预测等方法，明确这些功能基因的生物学功能。利用分子生物学实验技术，如基因敲除、过表达、RNA干扰等，进一步验证功能基因的功能，探究其在病毒生命周期和致病过程中的具体作用机制。

比较基因组学分析：将MsGV和SpltNPVⅡ的基因组与其他已测序的昆虫病毒基因组进行全面的比