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3
T/GRHAXXXX—2025
基于循环肿瘤DNA样本的非小细胞肺癌
相关基因变异高通量测序检测方法
1范围
本文件规定了采用高通量测序技术对外周血/脑脊液/浆膜腔积液样本中循环肿瘤DNA(ctDNA)进行非小细胞肺癌(NSCLC)相关基因突变的检测方法、术语和定义、检测方法原理、试剂和材料、仪器设备、样本采集与处理、检测流程、数据分析,以及性能确认和质量控制等内容。
本文件适用于临床医学领域中涉及高通量基因测序项目研发和应用的医疗卫生机构、第三方检测机构、技术研发企业等。
本文件适用于:
(1)拟接受靶向和免疫治疗,但组织或者细胞学样本不可及时,或所获得的组织标本质量不佳,或标本量不足以开展必需的多基因变异检测时的晚期NSCLC患者;
(2)IB-III期根治性切除术和局部晚期根治性放化疗完全缓解后进行分子残留监测(MRD),以及晚期系统治疗后缓解进行疗效监测和追求药物假期的NSCLC患者。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T30989—2014
高通量基因测序技术规程
GB/T35890—2018
高通量测序数据序列格式规范
GB/T40664—2021
用于高通量测序的核酸类样本质量控制通用要求
YY/T1946—2024肿瘤组织基因突变检测试剂盒(高通量测序法)
T/GDPMAA0011—2022医疗机构分子病理实验室建设规范
T/GDPMAA0012—2023高通量基因测序项目分类
T/GRHA0001—2024基于FFPE样本的非小细胞肺癌相关基因突变高通量测序检测方法
CNAS-CL02-A009—2018医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明
CNAS-GL039—2019分子诊断检验程序性能验证指南
CNAS-GL050—2021医学实验室分子诊断领域认可指南
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
循环游离DNACirculatingFreeDNA;cfDNA
是指释放到血浆或其他体液中的降解的DNA片段。这些DNA片段通常来源于细胞的凋亡或坏死过程。cfDNA在多种生理和病理状态下存在,包括正常组织的细胞更新、炎症反应、肿瘤细胞的死亡等。
3.2
循环肿瘤DNACirculatingtumorDNA;ctDNA
T/GRHAXXXX—2025
4
指由肿瘤细胞释放入血液循环系统/浆膜腔积液中的游离DNA片段。ctDNA会携带来源于肿瘤细胞相关的遗传学特征,如基因突变、甲基化、扩增或重排等,可作为肿瘤筛查、伴随诊断、治疗疗效评估及预后风险分层的重要指标。
[来源:《非小细胞肺癌分子残留病灶专家共识》,《ctDNA高通量测序临床实践专家共识(2022年版),非小细胞肺癌分子病理检测临床实践指南(2024版)》,参考并修改]。
3.3
高通量测序High-throughputsequencing
又称为二代测序(Next-generationsequencing,NGS),能够一次对大量核酸分子进行平行序列测定,通常一次测序反应能产出数百万至数亿条核酸片段的测序数据。
[来源:GB/T30989—2014,定义3.19,《高通量基因测序技术规程》,参考并修改]3.4
全外显子组测序Wholeexomesequencing;WES
指针对人类基因组全部蛋白质编码区域(外显子组)的基因集进行高通量测序。人类基因组中约有18万个外显子,约占基因组的1%,即约3000万个碱基对(30MB)。目前,全外显子测序已应用于单基因遗传病、肿瘤用药指导等。
3.5
靶向测序Targetedsequencing
通过特定的探针或引物,对基因组中特定基因和区域富集后进行测序。与全基因组测序和WES相比,靶向测序通过富集特定的基因区域,能够更高效、更经济地检测目标区域内的变异。
[来源:T/GDPMAA0012—2023高通量基因测序项目分类,参考并修改]3.6
非小细胞肺癌Non-smallcelllungcancer;NSCLC
非小细胞肺癌(NSCLC)是除小细胞肺癌(SCLC)以外、所有来源于肺上皮的各种类型癌症的集合体;常见类型有鳞状细胞癌、腺癌、大细胞癌等。NSCLC的发生率占肺癌总发生率的80%~85%,如果没有特别说明,肺癌指代非小细胞肺癌。
[来源:国家卫生健康委肿瘤和血液病相关病种诊疗指南(2022年版),《原发性肺癌诊疗指南(2024年
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