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重组gp41抗原表位在设计中的应用（四）

IVD拿铁

一、抗原的概念

抗原（Antigen）是指能够被免疫系统（如抗体、T细胞受体）识别并结合，并可能引发特异

性免疫反应的物质。抗原通常具备以下特性：

免疫原性（Immunogenicity）：能够刺激机体产生免疫应答（如抗体生成）。

抗原性（Antigenicity）：能与抗体或T细胞受体特异性结合。

根据抗原性质将抗原分为两类：

完全抗原（CompleteAntigen）：兼具免疫原性和抗原性（如细菌、病毒蛋白）。

半抗原（Hapten）：仅有抗原性，需结合载体蛋白（如BSA、KLH）才能诱导免疫应答（如小

分子药物、激素）。

抗原决定簇（Epitope）是指抗原表面能被抗体识别的特定区域，分为：

线性表位（linearepitope）：由连续氨基酸序列构成；

构象表位（ConformationalEpitope）：依赖蛋白质空间结构。

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抗原的应用：

抗原广泛用于疫苗开发、免疫诊断（如ELISA、胶体金试纸）和抗体制备（作为免疫原）。在

胶体金检测中，抗原常被固定在膜上（T线）或标记于金颗粒表面，用于捕获样本中的抗体（如

HIV双抗原夹心法）。

病原体抗原在免疫原性及变异特性上呈现显著多样性，以流感病毒为例，其表面糖蛋白抗原

血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）是典型代表。HA主要负责协助病毒包膜与宿主细胞膜融合及

介导凝血作用，NA则通过水解宿主细胞表面的唾液酸受体促进子代病毒释放；此外，核蛋白（NP）

作为内部抗原，参与病毒基因的复制、转录、翻译过程并维持基因稳定性，这些抗原共同构成了

流感病毒疫苗、药物及诊断试剂研发的关键靶点

二、抗原表位预测方法

抗原表位是抗原分子中能够被免疫系统识别并引发免疫应答的关键区域，可分为B细胞表位

和T细胞表位两大类。B细胞表位又分为线性表位（连续氨基酸序列）和构象表位（依赖空间结

构的非连续区域），其中构象表位占90%以上，但预测难度较大。表位研究对疫苗设计、诊断试剂

开发具有重要意义。

传统预测B细胞表位的方法有基于理化性质的方法（Hopp-Woods、Emini、Karplus-Schultz方

案），预测可能暴露在蛋白质表面的区域；基于二级结构的方法（GOR4、SOPMA等二级结构预

测工具），选择β转角、loop区域和无规卷曲区域这些可能成为表位的区域；基于机器学习的方

法（ABCpred、BepiPred等模型算法工具），根据已知表位数据集的训练结果来提高预测表位的准

确性。

随着研究者对蛋白质结构的解析的深入和AlphaFold3的出现，基于结构的B细胞表位预测

方法将更具吸引了，首先借助于结构预测工具获的抗原和抗体的三维结构，再通过分子对接技术

（如ZDOCK、RDOCK等工具）获得抗原-抗体复合物结构，分析抗原-抗体复合物结构进而预测

出抗原表位，这种表位预测方法将大大提升构象表位的预测准确度。

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三、抗原表位鉴定方法

3.1线性表位鉴定技术

3.1.1肽扫描技术（PeptideScanning）

通过化学合成一系列覆盖靶抗原全长的重叠短肽（15–20aa，重叠5–10aa），系统检测

其与抗体的结合活