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网络资源辅助药物设计教学方案

一、教学目标

本课程旨在通过系统整合各类优质网络资源，辅助学生深入理解药物设计的基本原理、核心策略与关键技术，培养学生利用现代信息技术手段解决药物研发实际问题的能力。具体目标如下：

1.知识目标：使学生掌握药物设计的基本概念、分子对接、虚拟筛选、药效团模型构建、ADMET性质预测等核心知识点；了解当前药物设计领域的前沿进展和常用网络资源平台的功能与特点。

2.能力目标：培养学生熟练运用指定网络资源进行靶点结构获取与分析、化合物库构建与虚拟筛选、分子间相互作用可视化与分析、以及化合物理化性质和ADMET性质预测的实践操作能力；提升学生自主学习、信息检索、数据分析及科学思维能力。

3.素质目标：激发学生对药物设计领域的兴趣，培养其创新意识、团队协作精神和严谨的科研态度，为其未来从事药物研发相关工作或进一步深造奠定坚实基础。

二、教学对象

药学、药物制剂、制药工程、生物制药、化学、生物化学与分子生物学等相关专业的高年级本科生或低年级研究生。学生需具备一定的有机化学、生物化学、分子生物学基础知识，并掌握基本的计算机操作技能。

三、教学内容与学时分配(示例：总计32学时，理论与实践并重)

|序号|教学模块|主要内容|学时|网络资源辅助方式|

|1|课程导论与基础回顾|药物设计概述、发展历程、基本策略；靶点与配体相互作用基础。|2|引导学生利用NCBIPubMed、GoogleScholar检索药物设计相关综述文献；推荐专业数据库（如PDB）初步认识蛋白质结构。|

|2|药物设计常用网络资源概览|数据库类（靶点、化合物、文献）、工具类（分子可视化、对接、筛选、ADMET）、学习社区与教程。|2|演示主要数据库（如PDB,UniProt,PubChem）和工具平台（如SwissDock,AutoDockVinaWebServer,SwissADME）的入口与基本导航。|

|3|靶点发现与验证|靶点的类型、发现方法、验证策略。|3|重点介绍OMIM、GeneCards、Ensembl等数据库的使用，指导学生查询特定疾病相关基因与蛋白信息；利用STRING等数据库分析蛋白相互作用网络。|

|6|分子对接原理与实践|分子对接基本原理、评分函数、对接软件介绍与操作。|6|以AutoDockVina（结合PyMOL插件或在线版本）或SwissDock为例，详细讲解对接参数设置、结果解读与可视化分析；利用PoseView等工具分析相互作用。|

|7|药效团模型构建与应用|药效团概念、元素、构建方法、基于药效团的虚拟筛选。|3|介绍PharmMapper等在线药效团预测与搜索平台；引导学生利用现有活性化合物在指定平台构建简单药效团模型并进行数据库搜索。|

|8|ADMET性质预测|吸收、分布、代谢、排泄、毒性（ADMET）性质的概念及其在药物设计中的重要性；常用预测方法。|4|重点教学SwissADME、PreADMET、ADMETlab等在线ADMET预测平台的使用，指导学生对筛选得到的化合物进行多参数评估与