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宁夏与新疆水稻种质资源的遗传多样性剖析及核心种质构建探究

一、引言

1.1研究背景与意义

水稻作为全球最重要的粮食作物之一，为超过半数的世界人口提供主食，在保障粮食安全方面发挥着无可替代的关键作用。中国作为水稻的起源中心之一，拥有着极为悠久的水稻种植历史和异常丰富的水稻种质资源。据统计，截至2023年，中国保存的水稻种质资源数量已超过8万份，位居世界前列。这些丰富多样的种质资源蕴含着众多优异基因，是水稻遗传改良和新品种培育的物质基础，对推动水稻产业的可持续发展意义重大。

宁夏和新疆虽地处我国西北内陆，气候干旱、降水稀少，但凭借独特的灌溉条件，水稻种植在当地农业生产中占据重要地位。宁夏自唐代中叶就已有大面积水稻栽培，建国以来，其水稻品种已历经6次更新换代，在品种资源的收集与保存工作上，宁夏自1981-1988年共征集国内外不同类型的水稻种质资源1480份，截至2009年，实际保存稻种资源3245份，涵盖国内引种2112份、国外引种1104份以及产地不明的29份。新疆水稻种植历史同样悠久，在长期的自然选择和人工驯化过程中，形成了适应当地特殊生态环境的水稻品种，这些品种具有耐旱、耐盐碱、抗寒等独特的优良性状。然而，由于自然环境变化、农业生产方式转变以及品种单一化种植等因素的影响，宁夏和新疆的水稻种质资源面临着遗传多样性降低、部分优异种质流失的严峻问题。

深入开展宁夏和新疆水稻种质资源遗传多样性分析及核心种质构建的研究，不仅有助于全面了解两地水稻种质资源的遗传背景和遗传结构，挖掘出具有重要应用价值的优异基因资源，为当地水稻新品种选育和遗传改良提供坚实的理论基础和丰富的材料支撑，从而推动当地水稻产业的高质量发展，提升农业生产效益和农民收入水平；而且能够丰富我国水稻种质资源库，为全国水稻种质资源的保护和利用提供有力补充，增强我国在全球水稻种质资源领域的竞争力，对于保障国家粮食安全和农业可持续发展具有深远的战略意义。

1.2国内外研究现状

在水稻种质资源遗传多样性分析方面，国内外学者已开展了大量研究工作，并取得了丰硕成果。早期主要利用形态学标记对水稻种质资源进行遗传多样性分析，通过观察和测量株高、穗长、粒形等形态性状，来评估种质间的遗传差异。但形态学标记易受环境因素影响，多态性较低，难以准确全面地反映种质资源的遗传多样性。随着分子生物学技术的飞速发展，限制性片段长度多态性（RFLP）、随机扩增多态性DNA（RAPD）、简单序列重复（SSR）、单核苷酸多态性（SNP）等分子标记技术逐渐应用于水稻遗传多样性研究。其中，SSR标记因其具有多态性高、共显性遗传、操作简便等优点，成为目前水稻遗传多样性分析中应用最为广泛的分子标记之一。例如，管俊娇等利用SSR标记对163份粳稻品种进行遗传多样性分析，结果显示品种之间亲缘关系相似程度与来源的地域性存在一定相关性；邓伟等利用基因芯片GSR40K并结合SNP分子标记，对135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源进行遗传多样性分析，发现不同海拔的种质资源存在丰富的遗传多样性。

在核心种质构建方面，国内外也取得了显著进展。核心种质的概念最早由Frankel于1984年提出，旨在通过筛选一小部分具有代表性的种质，来最大程度地保存整个种质资源群体的遗传多样性。构建核心种质的方法主要包括聚类分析法、遗传距离法、多次聚类随机取样法等。目前，已构建了野生稻、地方稻种资源和地方品种等多种类型的水稻核心种质。如陈雨以217份广东高州普通野生稻为基础材料，构建了一套包含24份野生稻的核心种质；李自超等以50526份中国地方稻种资源为基础材料，构建了一套包含4310份地方种质资源的初级核心种质。

然而，当前研究仍存在一些不足之处。一方面，针对宁夏和新疆等特定生态区域水稻种质资源的系统研究相对较少，尤其是对两地水稻种质资源遗传多样性的比较分析以及结合当地生态特点构建核心种质的研究尚显薄弱；另一方面，在核心种质构建过程中，如何更科学合理地确定取样策略和评价标准，以确保核心种质能够全面、准确地代表原始种质资源群体的遗传多样性，仍是亟待解决的问题。本研究将以此为切入点，深入开展宁夏和新疆水稻种质资源遗传多样性分析及核心种质构建的研究，以期为两地水稻种质资源的保护和利用提供科学依据和技术支持。

1.3研究目标与内容

本研究的主要目标是全面深入地分析宁夏和新疆水稻种质资源的遗传多样性，并构建具有代表性的核心种质，为两地水稻种质资源的有效保护、合理利用以及新品种选育提供坚实的理论依据和丰富的材料基础。

具体研究内容包括：一是对宁夏和新疆水稻种质资源的表型性状进行详细调查和分析，涵盖株高、穗长、粒形、粒重等多个方面，通过统计分析质量性状的频