DB12∕T 838-2018 辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法.docxVIP

ICS65.020.20B04

DB12

天津市地方标准

DB12/T838—2018

辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法

MethodofidentifyingseedpurityofpepperbyusingSSR-basedmarker

2018-12-01实施2018-11-07发布

2018-12-01实施

天津市市场和质量监督管理委员会发布

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DB12/T838—2018

前言

本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。

本标准由天津市农村工作委员会提出并归口。

本标准起草单位：天津市农业质量标准与检测技术研究所、天津市蔬菜研究中心、黑龙江省农业科学院农产品质量安全研究所。

本标准主要起草人：兰青阔、吕敬刚、赵新、王成、兰璞、焦荻、高素燕、陈锐、关海涛、张耀中、焦贺敏。

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DB12/T838—2018

辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法

1范围

本标准规定了辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法的原理、仪器设备及试剂、方法步骤、纯度计算。本标准适用于辣椒单交种的纯度鉴定。

2规范性引用文件

下列文件对于本标准的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本标准。凡是不注日期的引用文件，其最新版本(包括所有的修改单)适用于本标准。

GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

种子纯度seedpurity

种子在SSR分子标记带型方面典型一致的程度，用具有本品种特异带型的种子粒数占鉴定样品种子粒数的百分率表示，以反映某品种特征特性的一致性程度。

3.2

聚合酶链式反应polymerasechainreaction(PCR)

一种在体外通过酶促反应扩增特异DNA片段的技术。

3.3

简单重复序列simplesequencerepeat(SSR)

由几个核苷酸(1~6个)为重复单位聚集而成的长达几十个至几百个bp(一般为100～200)的串联重复序列，又称微卫星序列或短串联重复序列，其高度多态性主要来源于串联数目的不同。

3.4

分子标记molecularmarker

以蛋白质、核酸分子的多态性为基础，鉴定生物在遗传上的差异。

4原理

SSR分布于辣椒整个基因组，每个位点上重复单位的数目不同造成了品种间的多态性，利用PCR技术将多态的SSR扩增出来，通过电泳检测扩增产物，利用电泳图谱进行辣椒种子纯度鉴定。

5仪器设备及试剂

DB12/T838—2018

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5.1仪器设备

PCR仪；测序电泳槽；水平电泳槽：高压电泳仪(3000V,400mA,400W);万分之一电子天平；微量加样器；磁力搅拌器：台式离心机：紫外一可见成像系统：胶片观察灯：水平摇床；高压灭菌锅：pH计等。

5.2试剂

乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na2);三羟甲基氨基甲烷(Tris);盐酸(HCl,36%);十二烷基硫酸钠(SDS):氯化钠(NaCl):氢氧化钠(NaOH);硼酸；去离子甲酰胺：溴酚蓝：二甲苯青FF:甲叉双丙烯酰胺；丙烯酰胺；尿素；亲和硅烷；剥离硅烷；无水乙醇；四甲基乙二胺(TEMED);过硫酸铵；冰醋酸；硝酸银；甲醛溶液(37%);TaqDNA聚合酶(含Mg的10×PCR缓冲液);四种脱氧核糖核苷酸 (dNTPs);SSR引物；琼脂糖；GoldView染料；定性PCR试剂盒：DNA提取试剂盒；实验用水为重蒸馏水或符合GB/T6682规定的一级水等。除特殊说明外，所用试剂均为分析纯试剂。

5.3溶液配制

相关溶液配制方法见附录A。

6方法步骤

6.1取样

检测样品的分样和保存，应符合GB/T3543.2的规定，从中随机取100粒以上种子，取其父母本材料各10份。

6.2单粒种子的DNA提取

6.2.1样品预处理

在玻璃培养皿底部垫上一层厚度约3mm的棉花或滤纸，用水浸湿后均匀地撒上检测样品，再于表面覆盖一层纱布，置于光照培养箱中。培养条件为16h35℃光照培养，8h28℃暗培养，待种子长出子叶后备用。

6.2.2DNA提取

取单株幼苗子叶，放入1.5mL离心管中，在液氮中研碎，放入1.5mL离心管中。将DNA提取液预热到65℃,每管放入400μL混合样品，将离心管置于65℃金属浴或水浴锅中，保温30min后取