林木外生菌根 GST 基因家族选择压力 PAML 分支模型代码与结果试题库及答案.docVIP

林木外生菌根GST基因家族选择压力PAML分支模型代码与结果试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.PAML中用于分析分支模型的主要程序是（）

A.basemlB.codemlC.yn00D.chi2

答案：B

2.分析GST基因家族选择压力，PAML分支模型可检测（）

A.基因表达水平B.碱基突变C.选择压力D.蛋白结构

答案：C

3.PAML分支模型中ω值代表（）

A.同义替换率B.非同义替换率与同义替换率的比值

C.非同义替换率D.碱基转换率

答案：B

4.在分析林木外生菌根GST基因家族时，构建系统发育树常使用（）

A.BlastB.ClustalWC.MEGAD.PrimerPremier

答案：C

5.若某分支ω1，提示该分支经历了（）

A.纯化选择B.中性进化C.正选择D.负选择

答案：C

6.PAML输入文件格式要求序列为（）

A.FastaB.GenbankC.DocD.Xlsx

答案：A

7.对于林木外生菌根GST基因家族，PAML分支模型分析前要做（）

A.基因克隆B.序列比对C.蛋白提取D.细胞培养

答案：B

8.分析选择压力时，PAML分支模型与其他方法相比优势在于（）

A.操作简单B.结果直观C.能分析特定分支D.无需序列

答案：C

9.检验PAML分支模型结果显著性常用（）

A.t检验B.F检验C.χ2检验D.Z检验

答案：C

10.若要分析不同进化分支上GST基因家族选择压力，最好用PAML哪种模型（）

A.自由比率模型B.近中性模型C.位点模型D.分支位点模型

答案：A

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.以下属于PAML软件包含的程序有（）

A.basemlB.codemlC.evolverD.seqboot

答案：ABC

2.分析林木外生菌根GST基因家族选择压力，需准备的数据有（）

A.基因序列B.系统发育树C.表达量数据D.蛋白序列

答案：AB

3.PAML分支模型可以分析的选择压力类型有（）

A.正选择B.负选择C.中性选择D.平衡选择

答案：ABC

4.构建系统发育树可用于辅助PAML分支模型分析的软件有（）

A.MEGAB.PhyMLC.MrBayesD.DnaSP

答案：ABC

5.影响PAML分支模型分析结果准确性的因素有（）

A.序列质量B.系统发育树准确性C.模型选择D.样本数量

答案：ABCD

6.以下关于ω值说法正确的是（）

A.ω=1表示中性进化B.ω1表示纯化选择

C.ω1表示正选择D.ω可衡量选择压力大小

答案：ABCD

7.PAML输入文件中可能包含的信息有（）

A.序列数据B.树结构C.模型参数设置D.基因注释

答案：ABC

8.分析林木外生菌根GST基因家族选择压力，常结合的研究方法有（）

A.基因表达分析B.蛋白功能验证C.物种进化分析D.细胞定位

答案：ABC

9.在使用PAML分支模型分析时，模型假设条件有（）

A.序列进化符合特定模型B.系统发育树准确

C.碱基替换相互独立D.基因无重组

答案：ABC

10.PAML分支模型分析结果可以以哪些形式呈现（）

A.文本报告B.图表C.数据库D.视频

答案：AB

三、判断题（每题2分，共10题）

1.PAML只能用于分析蛋白质编码基因的选择压力。（）

答案：错

2.只要有基因序列就可以直接用PAML分支模型分析选择压力。（）

答案：错

3.ω值越大，说明基因受到的正选择作用越强。（）

答案：对

4.PAML软件操作简单，无需进行复杂的参数设置。（）

答案：错

5.构建系统发育树对PAML分支模型分析结果没有影响。（）

答案：错

6.负选择时ω1。（）

答案：对

7.PAML分支模型可以准确判断基因在所有进化分支上的选择压力。（）

答案：错

8.分析林木外生菌根GST基因家族选择压力，不需要考虑基因的功能。（）

答案：错

9.不同的PAML分支模型对数据的要求不