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基于异构并行系统的图神经网络分布式容错执行机制1

基于异构并行系统的图神经网络分布式容错执行机制

1.异构并行系统概述

1.1定义与特点

异构并行系统是一种由多种不同类型的计算单元组成的计算系统，这些计算单元

包括但不限于中央处理器（CPU）、图形处理单元（GPU）、现场可编程门阵列（FPGA）

等。这种系统能够充分利用不同计算单元的优势，实现高效的并行计算。其特点如下：

•高性能：通过将计算任务分配给不同类型的计算单元，异构并行系统能够充分发

挥各单元的计算能力，从而实现高性能计算。例如，在处理大规模矩阵运算时，

GPU的并行计算能力可以显著提高计算速度，而CPU则可以处理复杂的控制逻

辑。

•高能效：不同计算单元在处理不同类型任务时的能效比不同。异构并行系统可以根

据任务需求选择合适的计算单元，从而在保证性能的同时降低能耗。例如，FPGA

在处理特定类型的信号处理任务时，其能效比远高于通用CPU。

•灵活性：异构并行系统可以根据不同的应用需求灵活配置计算单元，满足多样化

的计算需求。例如，在深度学习任务中，可以增加GPU的数量以加速模型训练；

在实时信号处理任务中，可以增加FPGA的数量以满足实时性要求。

1.2架构组成

异构并行系统的架构主要由以下几个部分组成：

•计算单元：这是异构并行系统的核心部分，包括CPU、GPU、FPGA等。这些计

算单元通过不同的接口与系统其他部分相连，共同完成计算任务。例如，CPU通

常通过PCIe接口与GPU和FPGA通信，而GPU和FPGA之间也可以通过高

速互连技术（如NVLink）进行数据传输。

•存储单元：存储单元用于存储计算任务所需的数据和中间结果。异构并行系统通

常采用层次化的存储架构，包括高速缓存、内存和外部存储设备。例如，CPU和

GPU都有自己的高速缓存，用于存储频繁访问的数据，以减少访问延迟。

•互连网络：互连网络用于连接各个计算单元和存储单元，实现数据的高效传输。常

见的互连网络包括PCIe、InfiniBand等。例如，InfiniBand是一种高性能的互连

网络，能够提供高带宽和低延迟的数据传输，适用于大规模并行计算系统。

2.图神经网络基础2

•软件栈：软件栈是异构并行系统的重要组成部分，包括操作系统、运行时库、编

译器等。操作系统负责管理系统的资源，运行时库提供了对计算单元的访问接口，

编译器则负责将高级语言程序转换为可在异构系统上运行的代码。例如，CUDA

是一种用于GPU编程的运行时库，它提供了一系列的API，使得开发者可以方

便地在GPU上实现并行计算。

2.图神经网络基础

2.1基本概念

图神经网络（GraphNeuralNetworks，GNNs）是一种用于处理图结构数据的深度

学习模型。图结构数据由节点（Node）和边（Edge）组成，节点表示实体，边表示实体

之间的关系。GNNs通过学习节点的表示来捕捉图中的结构信息和节点特征信息，从而

实现对图结构数据的建模和分析。

•基本原理：GNNs的核心思想是通过聚合邻居节点的信息来更新当前节点的表示。

具体来说，每个节点的初始表示通常是其特征向量，然后通过迭代的方式，将邻

居节点的表示聚合到当前节点，更新当前节点的表示。这个过程可以表示为

h(k+1)=f(h(k),{h(k)|u∈N(v)})

vvu

，其中h(k)表示节点v在第k层的表示，N(v)表示节点v的邻居节点集合，f

v

是聚合函数，通常是一个神经网络。

•主要模型：常见的GNN模型包括图卷积网络（GraphCo