基于线粒体D-loop序列的江苏克氏原螯虾养殖群体遗传多样性分析.pdfVIP

—１９２—江苏农业科学２０２４年第５２卷第１０期

鲁苏皖，徐宇，李佳佳，等．基于线粒体Ｄ－ｌｏｏｐ序列的江苏克氏原螯虾养殖群体遗传多样性分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０２４，５２（１０）：１９２－１９６．

ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０２４．１０．０２６

基于线粒体Ｄ－ｌｏｏｐ序列的江苏克氏原螯虾

养殖群体遗传多样性分析

１，２２２１，２２２１１，２

鲁苏皖，徐宇，李佳佳，高志宝，严维辉，许志强，王兴强，李旭光

（１．江苏海洋大学海洋科学与水产学院，江苏连云港２２２００５；

２．江苏省淡水水产研究所／农业农村部淡水虾蟹遗传育种与养殖重点实验室，江苏南京２１００１７）

摘要：江苏是我国克氏原螯虾的主产区，近年来繁养模式不断变化，多代繁养后的遗传多样性变化情况尚未可知，

以及江苏地区克氏原螯虾养殖种群的群体遗传学特征数据尚不清楚。为研究当前江苏主产区克氏原螯虾养殖群体的

遗传多样性特征，对来自江苏南京、徐州、连云港、扬州、淮安、无锡、泰州兴化和宿迁泗洪的８个克氏原螯虾养殖群体

样本的线粒体控制区Ｄ－ｌｏｏｐ基因片段进行ＰＣＲ扩增和测序分析，分析了不同养殖群体的遗传结构特点。共测序获

得了８个群体２２３个样本的线粒体Ｄ－ｌｏｏｐ序列，比对长度包括８６３个位点，其中，变异位点９５个，简约信息位点２５

个。基因序列中ＡＴ含量（８０．０１％）高于ＣＧ含量（１９．９９％），表现出较为明显的碱基组成偏倚性。２２３个样本共定义

了３７种单倍型，其中，单倍型Ｈａｐ１为８个群体的共有单倍型。泗洪群体独有的单倍型最多，泰州兴化群体独有的单

倍型最少。本研究所涉及的养殖群体总体单倍型多样性指数（Ｈ）为０．３９，总体核苷酸多样性指数（Ｐ）为０．００３３７，

ｄｉ

遗传多样性处于较低水平。其中，宿迁泗洪群体的遗传多样性指数最高（Ｈ为０．６３２），兴化群体的遗传多样性指数

ｄ

最低（Ｈ为０２２８）。不同群体间的遗传距离总体较小，其中，南京群体与其他群体间的遗传距离相对较大（０．００５），

ｄ

提示南京群体与其他群体间的基因交流较少。８个养殖群体间的遗传分化系数为－０．２１９６～０．３１７３３，徐州、扬州、

无锡及连云港群体间的遗传分化系数为负值，表明这些群体间存在较为频繁的基因交流。分子方差分析（Ａ－

ＭＯＶＡ）结果显示，９５．３５％的遗传变异来自于群体内，群体间的遗传变异较少（４．６５％）。最小跨度网络图和系统发育

分析均未显示出单倍型与不同群体的对应关系，提示当前江苏克氏原螯虾养殖群体间的基因交流较为频繁。

关键词：克氏原螯虾（Ｐｒｏｃａｍｂａｒｕｓｃｌａｒｋｉｉ）；江苏地区；遗传多样性；遗传结构

中图分类号：Ｓ９６８．２２文献标志码：Ａ文章编号：１００２－１３０２（２０２４）１０－０１９２－０５

克氏原螯虾（Ｐｒｏｃａｍｂａｒｕｓｃｌａｒｋｉｉ）俗称小龙虾，程中的“逆向选择”问题较为严重。水产养殖群体

属于节肢动物门甲壳亚目软甲纲十足目螯虾科，原的遗传多样性评估对良种选育和资源保护等方面

产于美洲，２０世纪３０年代从日本引入我国南京，具有重要意义。王长忠等对长江中下游地区野生

２的克氏原螯虾的遗传多样性进行了本底调查，研究

２０２１年，我国克氏原螯虾养殖面积１７３万ｈｍ、产量

２６３．３６万ｔ，现已成为我国最重要的水产经济物种表明４个克氏原螯虾群体的遗传多样性处于中等水

［１］［２］

之一。长期以来，国内克氏原螯虾养殖过程中普平。曹玲亮使用了微卫星标记分析了安徽３个

遍采用繁养一体的繁育方式、捕大