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生物信息学数据分析工具考核试卷及答案

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

选择题：

1.下列工具中，专门用于短读序列（Shortreads）基因组比对的是（）。

A.BLASTN

B.BLAT

C.BWA

D.EMBOSSneedle

2.在转录组数据分析中，用于差异表达基因筛选且基于负二项分布模型的工具是（）。

A.edgeR

B.limma

C.SAMtools

D.Cufflinks

3.对基因组变异进行功能注释时，可整合多数据库信息（如dbSNP、ClinVar、COSMIC）的工具是（）。

A.SnpEff

B.ANNOVAR

C.VEP

D.bcftools

4.使用GATK进行SNP检测时，若输入文件为BAM格式，需通过以下哪个命令进行排序？

A.SortSam

B.samtoolssort

C.PicardSortSam

D.以上都是

5.在构建系统发育树时，MEGA软件中用于计算遗传距离（基于Kimura-2-Parameter模型）的菜单路径是（）。

A.Analysis→DistanceComputation→ComputePairwiseD