表达谱数据分析：GO分析与聚类方法应用.pdfVIP

表达谱数据的GO分析和聚类分析

交通大学

GO（geneontology）是本体（GeneOntologyConsortium）所建立的数据库。

GO是多种生物本体语言中的一种，旨在建立一个能阐释各种物种的以及产物。这

个数据库最开始于三个模式生物的数据库：果蝇组数据库（Drosophila）、酵母

组数据库（SaccharomycesGenomeDatabase，SGD）、小鼠组数据库（Mouse

GenomeDatabase，MGD）。在这，在本体成员的努力下，将GO数据库扩

展到了植物、动物、微生物等世界范围内各个主要的数据库。GO数据库建立了具有三层结

构的定义方式来描述及其产物的生物学过程、细胞组分及分子功能，对不同信息源的信

息进行整合，以DAG（有向无环图）结构组织起来作为多个分支，节点的高低也代表了每

个节点的意义的广泛程度。每个父项（parentterms）下包含若干子