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分子植物育种，2025年，第23卷，第1期，第477-4781页

MolecularPlantBreeding,2025,Vol.23,No.14,477-4781

研究报告

ResearchReport

基于转录组测序的矩镰荚苜蓿SSR和SNP特征分析

刘艳王霞贾秀秀方强恩*

甘肃农业大学草业学院,中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,草业生态系统教育部重点实验室,兰州,730070

*通信作者,fangqen@163.com

摘要矩镰荚苜蓿(Medicagoarchiducisnicolai-)广泛分布于中国西北高寒区，具有抗寒抗旱、耐牧耐贫瘠

等优良特质，是一种具有较高开发价值的野生豆科牧草。为了深入研究矩镰荚苜蓿SSR和SNP，分析其整体

分布变化规律及组成结构特征，本研究利用高通量分子测序方法对矩镰荚苜蓿地下芽进行转录组测序分析，

通过MISA和GATK分析了植物转录本资料中的SSR和SNP相关信息。通过测序分析，共获得62810条

unigene序列，总长度p，其中有19450条unigene序列含有SSR位点，经过位点搜索后共发

现SSR位点2891个，出现频率为46.0%，主要的优势重复类型为单核苷酸重复；AT和AGCT这两种基//