肿瘤微环境单细胞测序研究进展.ppt

细胞通讯网络构建配体-受体互作预测使用CellPhoneDB或NicheNet分析细胞间信号通路（如CCL5-CCR5介导的TAM与T细胞互作），筛选显著互作对（p0.05）并可视化热图。结合CODEX或Visium数据定位互作细胞的空间邻接关系（如PD-L1+肿瘤细胞与PD-1+T细胞的免疫突触距离），增强互作可信度。通过加权基因共表达网络（WGCNA）识别协同作用信号模块（如VEGF通路相关内皮细胞-成纤维细胞互作），关联治疗耐药性表型。空间共定位验证功能模块挖掘多组学整合分析策略08转录组与蛋白组联合差异表达关联分析通过对比转录组差异基因与蛋白组差异蛋白的表达趋势