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科研行业实验室研究员实验数据分析手册

第1章实验数据导入与预处理

1.1常见文件格式解析与转换

当从不同实验室或外部平台获取原始数据时，往往同时存在Excel(.xlsx)、CSV(.csv)和Parquet(.parquet)等多种格式，其中Excel文件因包含大量公式和单元格格式而难以直接读取，因此需先使用Python的`pandas`库读取CSV文件，通过`to_excel()`函数将其转换为标准格式，便于后续统一处理。针对包含复杂图表和公式的Excel文件，若需导入，应利用`openpyxl`库加载`.xlsx`文件，通过提取其中的“工作表名称”和“单元格内容”，利用正则表达式去除非数值字符（如公式符号、分隔符），仅保留纯数字和科学计数法表示的数值，再将其写入CSV格式以便程序解析。

对于从数据库（如SQLServer或Oracle）导出的数据，由于存在引号包裹和特殊字符，需使用`sqltools`库执行`SELECT`查询，并通过`to_csv()`方法将结果导出，在导出设置中务必勾选“包含表头”选项，以确保第一行被识别为列名。若数据源为网络流式数据或传感器日志，直接导入会导致内存溢出，此时需采用`dask`库配合`read_csv()`或`read_json()`函数，设置