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并行耗散分子动力学：原理、算法与应用进展

一、引言

1.1研究背景与意义

在过去的几十年里，计算机技术以惊人的速度持续进步，从早期的大型机到如今的超级计算机与云计算，每一次技术革新都极大地拓展了人类的计算能力。这一发展趋势在科学研究领域尤为显著，高性能计算已成为推动各学科进步的关键力量，如物理学中对微观粒子相互作用的模拟、生物学中对蛋白质折叠结构的预测，以及化学中对复杂化学反应过程的探究等。在这样的大环境下，采用高性能计算以及新型算法开展分子模拟研究，已成为当下科学研究的前沿方向。

耗散分子动力学（DissipativeParticleDynamics，DPD）作为分子模拟的重要手段，在