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四倍体长牡蛎育种芯片

关键技术研究

摘要：三倍体长牡蛎具备生长速度快、糖原积累水平高、繁殖周期肉质品质稳定等突出优势，现已成为我国海水贝类养殖产业的核心良种资源，四倍体长牡蛎则是培育三倍体苗种必不可少的亲本种质材料。传统四倍体牡蛎选育手段主要依托外观表型开展人工筛选，普遍存在育种周期漫长、倍性分型难度较高、近亲繁育引发种质衰退、优良性状定向筛选效率偏低等现实问题，缺少适配四倍体遗传特征的专用分子检测工具，长期制约贝类多倍体育种产业迭代升级。鲁东大学科研团队研制出国际上首款四倍体长牡蛎液相育种芯片“鲁东蛎芯4N一号”，探针集合共计41270个高质量SNP标记位点，攻克四倍体复杂染色体倍性条件下的基因分型技术难点，将深度学习分型算法与靶向液相捕获测序技术相结合，可完成优良性状早期预判、亲贝配组方案优化、家系亲缘关系解析、功能基因挖掘等多项工作，分型准确率超过90%，良种选育周期能够缩减50%以上。本文围绕该育种芯片的研发流程、核心技术体系、性能指标以及产业化落地场景开展系统分析，探讨现有技术尚存的短板，对贝类多倍体基因组育种后续发展方向进行展望，为牡蛎种业自主创新以及其他海水经济贝类育种芯片开发提供实践参考。

关键词：长牡蛎；四倍体；单核苷酸多态性；液相育种芯片；基因组选择；水产种业

Abstract:TriploidPac