转录组分析专题方法技术课件.pptxVIP

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  • 2026-10-02 发布于河南
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SPECIALTOPIC转录组分析专题方法技术课件原理·流程·工具·管线·富集·单细胞日期2026年

课程导览01技术原理与数据基础测序原理、实验流程与主流数据格式02上游分析全流程质控、比对、定量的核心环节贯通03工具软件与管线选型主流工具对比与三大分析管线04下游分析与功能挖掘差异表达分析与GO/KEGG富集05单细胞转录组拓展从群体平均到单细胞精度06实操建议与工程化环境管理、批处理与规范落地

章节技术原理与数据基础读懂数据,才能读懂分析从测序原理到数据格式,打好分析地基01

技术定义与技术分类一次测序,同时看清基因表达与转录本结构RNA-seq一次测序,同时看清基因表达与转录本结构核心定义通过高通量测序技术对细胞或组织中的RNA开展测序分析,以mRNA为主,也涵盖非编码RNA可解析信息基因表达水平、可变剪接、融合基因、转录本结构、RNA突变技术分类按测序技术分为短读长、长读长与直接RNA测序三类主流地位SRA数据库获取的RNA-seq数据中,超过95%由Illumina短读长测序技术产生分析基线常规分析流程与算法基本围绕短读长数据构建

文库构建到上机测序数据质量问题,往往在建库阶段就已注定1RNA富集与质控DNAse去除基因组DNA污染,polyA富集mRNA或去除rRNA凝胶电泳、生物分析仪测定RIN值评估RNA完整性2片段化与筛选酶促、化学或

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