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临床试验数据的SAS模块化分析.ppt
我所理解的临床试验数据编程原则 尽可能利用SAS固有的过程,尽量少编写SAS没有的算法; 充分利用DATA步来实现数据的输出格式控制,以减少填表过程中出现的错误; 编写适用于报告中的各种表格的宏程序库。 尽可能利用SAS固有的过程 要用SAS,就必须采用SAS的固有输出结果,你所要做的仅仅是把你要的结果放在该放的地方。这样才能保证SAS固有的算法上的可靠性,才能保证统计分析结果的可靠性、可再现性和试验间的可比性。 夏结来 输出格式控制 控制输出格式的方法 将各过程的输出结果导出为数据表 各Procedure下的Output,如ANOVA, Freq 有些Procedure下只能用ODS,如ttest, Genmod 活用DATA步的Merge、Set命令和有关的格式控制命令; 尽可能将所有的结果都以字符的形式存入一个输出数据表;尽可能将同一张表一次性输出; 技巧:频数表的输出结果控制 直接用Freq命令的缺点: 用Freq过程直接输出难以控制输出格式 多余的”-””+”等等 存在着某些类别没有频数的情形,导致Freq输出信息不完整。 data test; input f a b@; cards; 20 1 1 15 1 2 0 2 2 0 2 2 ; proc freq data=test; title 带有频数为0的四格表; tables a*b/nocol nopercent; weight f; run; 解决方法: 生成一个包含了全部可能取值的数据表; 再将Freq的输出数据表和该数据表合并; 利用Do循环分别从合并后的数据表中取出每一行的频数及频率,最后组合在一起。 DATA APPEND; DO a=1 TO 2; DO b=1 TO 2; OUTPUT; END; END; RUN; ODS OUTPUT CrossTabFreqs=temp2; proc freq data=test; tables a*b/NOCOL NOROW NOPERCENT NOCUM; weight f; run; ODS OUTPUT CLOSE; RUN; PROC SORT DATA=temp2;BY a b;RUN; PROC SORT DATA=APPEND;BY a b;RUN; DATA temp3;MERGE temp2(keep=a b frequency) APPEND; BY a b; IF FREQUENCY=. THEN FREQUENCY=0; if a~=. and b~=.; RUN; %MACRO DIST(); DATA ALLROW;SET _NULL_;RUN; %DO I=1 %TO 2; DATA ROWI;SET _NULL_;RUN; DATA ROWI;SET TEMP3;IF A=I;KEEP FREQUENCY;RUN; PROC TRANSPOSE DATA=ROWI OUT=ROWI;RUN; DATA ROWI;SET ROWI;DROP _NAME_ _LABEL_;A=I;OUTPUT;RUN; DATA ALLROW;SET ALLROW ROWI;RUN; %END; DATA ALLROW;SET ALLROW; COL3=COL1+COL2; COL4=PUT(100*COL1/COL3,8.2); COL5=PUT(100*COL2/COL3,8.2); IF COL4= THEN COL4=-; IF COL5= THEN COL5=-; LABEL COL1=阳性 COL2=阴性 COL3=合计 COL4=阳性率 A=分组; RUN; %MEND; 编写适用于报告中的各种表格的宏程序库 从临床试验规范化的角度看,程序员所编写的程序应当由专人复核,这就要求程序员所撰写的程序必须尽可能清晰易懂;最好是统计分析报告中的每一个输出表格都对应一个宏。 在宏程序中增加选项的设置,强化某一个宏程序的功能,减少宏的个数。 这样程序审核者只要检查宏调用的参数是否正确便可。 %BASETEST(TABNUM,TABTITLE,DATANAME,V,VLABEL,K,TYPE,CODE,COND); 用于对基线的人口资料进行比较, %OUTDEF(); %BASETEST(4.1,基线情况比较,FAS,AGE,年龄,1,QT,,); %BASETEST(4.1,基线情况比较,FAS,BC,病程,1,QR,,); %BASETEST(4.1,基线情况比较
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