线粒体COI基因在昆虫DNA条形码中的研究与应用.pdfVIP

应用 昆虫学报 ChineseJournalofAppliedEntomology 2012，49(6)：l687—1695 线粒体 COI基因在 昆虫DNA条形码中的 研究与应用术 杨倩倩 李志红 伍 神 柳丽君 (中国农业大学农学与生物技术学院 北京 100193) 摘 要 自2003年DNA条形码 (DNAbarcodes)概念出现以来，DNA条形码技术 (DNAbarcoding)受到生物分类 学领域普遍关注，线粒体细胞色素氧化酶亚基 I(mtDNACOI)被用作动物类群的主要条形码序列，基于该基因片 段的昆虫条形码研究在国内外广泛开展。本文在概述DNA条形码、条形码技术及 已开展的昆虫条形码研究计划 的基础上，总结了昆虫mtDNACOI条形码及其技术在发现和描述隐种、种类分子鉴定以及系统发育等方面的研 究进展，分析了细胞核线粒体假基因(Numts)对 mtDNACOI条形码扩增的影响，提出检测和避免 Numts的方法， 并对 DNA条形码技术 的进一步研究和应用进行 了讨论和展望 。 关键词 DNA条形码 ，DNA条形码技术 ，mtDNACOI，昆虫 Advanceand application ofmtDNA COI barcodesoninsects YANGQian—Qian LIZhi—Hong WUYi LIULi—Jun (CollegeofAgronomyandBiotechnology，ChinaAgricuhuralUniversity，Beijing 100193，China)． Abstract DNA barcodinghasbeenwidelyusedintaxonomysincetheconceptappearedin2003．Themitochondrialgene cytochromeCoxidaseI(COI)isregardedasoneofthemostacceptablemolecularmarkersandinsectDNA barcoding researchbasedonthisgenehasbeendevelopedinternationally．ThispapergivesageneralintroductiontoDNA barcodes， DNAbarcodingandinsectDNAbarcodeprojects．ItsummarizesresearchintoandtheapplicationofinsectmtDNA COI barcodinginthedescriptionofcrypticspecies，speciesmolecularidentificationandphylogenetics．Inaddition，weanalyse theinfluenceofcoamplificationofNumtswithmtDNA COI barcodes，presentingseveralsuggestionsondetectingand avoidingNumts．Finally，wediscussfutureprospectsforDNA barcoding． Keywords DNA barcodes，DNA barcoding，mtDNA COI，insect DNA条形码 (DNAbarcodes)是生物基因组 中 虽然DNA条形码技术应用广泛，但也存在一 普遍存在 的一段短 的标准 DNA序列 ；基于 DNA 些技术上的难题 ，其 中最主要是如何避免旁系同 条形码序列分析而形成 的技术体系 ，即DNA条形 源序列 的协 同扩增 (coamplification)。DNA序列 的 码技术 (DNAbarcoding)出现在生物分类学 的关键 直系同源性是条形码研究的基本假设，而旁系同 时代 ，成为促 进该传 统学科 复兴 的原 因之一 源序列 的协 同扩增将造成 DNA条形码的错误分 (Heberteta1．，2003a；Hebert，200