GenBank数据库检索及其应用——Entrez检索功能.ppt

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GenBank数据库检索及其应用 ——Entrez检索功能 重庆医科大学图书馆 李 轶 Nucleotide 数据库分为三个子数据库: EST :表达序列标记数据库 GSS :基因组测序序列数据库 CoreNucleotide :包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列 检索限定词: 1、基因名称的检索限定词:[GENE] or [GENE NAME] 2、生物体名称的检索限定词:[ORGN] or [ORGANISM] 3、作者姓名的检索限定词:[AUTH] or [AUTHOR] 特殊标志符的格式(核酸序列) : 特殊标志符的格式(核酸序列) : 2、GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号: (1)1个字母+5个阿拉伯数字 e.g.:U12345 (2)2个字母+6个阿拉伯数字 e.g.:AY123456,Af123456 范围检索:中间用冒号连接 1、序列接受号范围检索: AF114696:AF114714[ACCN] 2、序列长度范围检索: 3000:4000[SLEN] 3、日期范围检索: 2005/01:2006/09/26[MDAT]or[PDAT] GenBank记录中特性表中的主要关键词: Ge

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