GenBank数据库检索及其应用-欢迎光临浙江大学生命科学学院.ppt

GenBank数据库检索及其应用——Entrez检索功能 重庆医科大学图书馆 李 轶 GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较： 1、GenBank的检索结果是序列及其注释信息； PubMed的检索结果是与序列数据相关的文献信息。 2、GenBank数据更新早于PubMed，GenBank数据库的检全率高于PubMed。 3、 GenBank可对序列数据进行限制检索，而PubMed只能对文献、杂志、作者等进行限制检索，因而GenBank数据库的检准率也高于PubMed。 检索限定词： 1、基因名称的检索限定词：[GENE] 2、生物体名称的检索限定词：[ORGN] 3、作者姓名的检索限定词：[AUTH] 特殊标志符的格式（核酸序列） ： 2、GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号： (1)1个字母+5个阿拉伯数字 e.g.：U12345 (2)2个字母+6个阿拉伯数字 e.g.：AY123456，Af123456 范围检索：中间用冒号连接 1、序列接受号范围检索： AF114696:AF114714[ACCN] 2、序列长度范围检索： 3000：4000[SLEN] 3、分子重量范围检索： 2002：2009[MOLWT] 4、日期范围