大肠杆菌铵载体蛋白AmtB的演化、结构和功能分析-Evolution,.pdfVIP

Evolution, structure and function analysis of AmtB, the ammonium transporter in Escherichia coli 组别：G03 汇报人：谢夏青 组长：樊程 组员：董志老师，谢夏青，熊梦吟 汇报内容  研究背景  研究内容  研究总结 研究背景  氮素代谢是一种重要的生命活动，铵离子是这个代谢环节 的中心元素。铵载体保证了生物体内铵离子库的动态平衡。 AmtB蛋白是一类位于细胞膜 上，能够主动转运铵离子的载 体蛋白，属于Amt/Mep/Rh蛋 白超家族。  该蛋白是由三个相同的亚基构 成的三聚体。 Shahram et al. 2004 每一个单体由十一个跨膜区组 成。 从原核到真核均有同源蛋白， 且蛋白结构具有高度的保守性。 Shahram et al. 2004 研究内容 对Amt/Mep/Rh蛋白超家族成员进行多序列比对 提取位于微生物、植物、动物中的该蛋白超家族74名 成员的蛋白质序列 1. 利用MEGA进行多序列比对，构建系统发育树。 2. 利用MEME进行序列保守位点分析，绘制图谱。 系统发育树 Mep Rh 该蛋白超家族 主要分为两大枝  Mep和AmtB共为 一枝  Rh单独一枝 AmtB 序列保守位点分析 40-110bp； 43aa 170-250bp ； 42aa 290-360bp ； 43aa 序列保守位点分析 研究内容 对Amt/Mep/Rh蛋白超家族的跨膜结构进行分析 选取大肠杆菌AmtB 、水稻Amt1 、酵母Mep 、人Rh 的 蛋白序列，对其跨膜结构进行分析 1. 利用TMAP分析以上序列的跨膜结构 2. 利用SOUSI分析以上序列的跨膜结构 TMAP结果 E.coli human rice yeast SOUSI结果 E.coli human rice