不确定图数据管理研究现状.pdfVIP

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第 5 卷 第 4 期 2009 年 4 月 不确定图数据管理研究现状 高 宏 张 炜 关键词 :不确定图 数据管理 哈尔滨工业大学 不确定图无处不在 如亚当斯 (J. Adam s )、泰勒 (C. Taylor )、 邦坦 (W. Buntine )等。又如化合物分子结构 近年来,随着信息技术的发展,在一些 图 (见图1 )中 “节点”可以表示碳、氢和氧 应用领域中,数据呈现出结构化强、数据间 等原子或表示具有一定反应活性的官能团, 关系复杂等新特点,主要体现在两个方面: “边”表示原子之间的键,可以是单键、双 (1 )数据对象本身具有拓扑结构。例如在分 键或三键。这些图数据具有如下特点: 子化合物数据库中,每个数据对象 是一个分子化合物,该化合物可以 H H 表示为一个具有几何结构的图 (见 C C 图1 ),图中的 “节点”表示化合物 H C C H 的原子, “边”表示原子间的化学 C C 键。此外,蛋白质的三级结构和XML (EXtensible Markup Language ,可 H H 扩展置标语言)文档也可以表示为 图1 阿斯匹林(Aspirin)分子结构和苯环结构 具有拓扑结构的图。 (2 )数据对象 之间的关系复杂。例如,关系数据库中通常包 结构复杂 根据图中节点、边之间的关 含多个关系表,这些不同表中的记录通过主- 系,图模型可以大致分为有向图模型、无向图 外键的对应关系构成了复杂的联系。由于图模 模型和多图模型。若图中任意两个节点之间的 型具有很强的表达能力,因此在传感器网络拓 边为有向边,则该图模型为有向图模型;若有 扑结构、社会关系网络、道路交通网络和互联 向图中不存在环路,则称之为有向无环图;若 网拓扑结构等领域普遍采用图模型描述数据以 图中任一两个节点之间的边为无向的,则该图 及它们之间复杂的相互关系。由图模型描述的 模型为无向图模型。 数据通常称为 “图数据”。以合著作者 (C o- 1 数据量十分庞大 在KE GG 数据库中包含 au th o r )关系网络为例 (如图2 ),可以用图 了超过15000条的P athway (路径)数据,在化 表示合著者关系网络,图的 “节点”表示作 学信息中,迄今为止,已知的有机化合物分子结 者,图中两个节点之间的 “边”表示对应的 构就有上千万种,其对应的化合物反应过程则已达 作者之间有论文合作关系。从图中可以看到 到上亿种。就单图来讲,在一幅描述社会关系网络 史密斯 (P. Smyth )和许多人合作写过论文, 的图中就可以包含几万甚至几十亿个节点 (边)。 1 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,一个基因组破译方面的数据库,见http://www.genome. ad.jp/kegg/pathway.html 31 专题 第 第 5 卷

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