泥蚶34个EST-SSR标记的开发及在格粗饰蚶中的通用性检测.pdfVIP

第 卷第 期 水 产 学 报 年 月 文章编号 泥蚶 个标记的开发及 在格粗饰蚶中的通用性检测 董迎辉 吴国星 姚韩韩 边平江 赵德 林志华 浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验浙江 宁波 浙江省海洋水产养殖研究所浙江 温州 摘要 利用泥蚶转录组高通量测序拼接获得的大量序列开发标记在 条 序列里筛查到 条含有位点的序列其中 个位点适合设计引物在位点两侧设 计引物并进行扩增 结果显示 对引物获得稳定扩增的位点引物在泥蚶奉化群体的 多态性检测中发现有 对引物表现出多态性共扩增出 个等位基因各位点的等位基因 数 为 个平均每个位点产生 个等位基因观测杂合度 期望杂合度 多态信 息含量范围分别为 平衡检 测显示 个位点偏离了平衡状态用 和 蛋白质数据库对含有多态性 的 进行了基因注释 个 位点来自注释基因序列 将 对泥蚶多态性 引物在格 粗饰蚶中进行了通用性检测结果有 对成功扩增 对表现为多态通用率为 这些 通用引物可用于两种蚶的遗传多样性评价系统进化分析 比较作图和基因发掘等研究 关键词 泥蚶 多态性 通用性 格粗饰蚶 中图分类号 文献标志码 微卫星标记 具有 民喜食的海鲜佳品也是我国四大养殖贝类之一 多态性丰富共显性遗传重复性好操作分析简单 然而目前有关泥蚶分子标记方面的研究报道不 等优点已被广泛用于种群遗传多样性评价遗传连 多主要采用 技术对泥蚶不同地理 锁图谱构建分子标记辅助育种等领域 近年来 群体 快速生长家系 的遗传结构和遗传 随着高通量测序产生 的海量 变异进行了分析而泥蚶 标记的研究仅见通 基于序列大量开发 标记的 过磁珠富集法从基因组中开发了 对多态性 技术正在得到广泛应用 来源于基因表达 引物 本研究在 高通量转录组测序的 序列与基因组来源的相比具有可能与基因功 基础之上利用测序并拼接组装获得的大量 能相关种间通用性好开发成本低且周期短等优 序列规模化开发微卫星标记并在具有较大保护 价 值 和 开 发 潜 力 的 格 粗 饰 蚶 点 目前在海洋双壳贝类中已见海湾扇贝 中进行通用性检测可望为泥蚶和格 栉 孔 扇 贝 粗饰蚶种质资源保护遗传多样性评价系统进化 太平洋牡蛎 文