水稻中结瘤素基因的同源基因研究.pdfVIP

维普资讯 中国水稻科学 (c^nP JRiceSci)．2005·19(3)：202~208 http：／／www．ricescience．org 水稻中结瘤素基因的同源基因研究 王彦章 俞冠翘 朱家壁 (中国科学院 上海生命科学研究院 植物生理生态研究所 植物分子遗传 国家重点实验室 ，上海 200032； 通讯联系人 ·E-mail：jbzhu@ii· sipp．ac．cn) HomologuesofNodulinGenesinOryzasativa WANGYah—zhang，YuGuan—qiao，ZHUJiabi (Nn￡o加 Lnborator o／PldHtMolec“larGenetics，InstituteofPlantPhysiology Ecology，ShanghaiInstitutesforBiologicalScienfes ChineseAcademyofSciences．Shanghai200032，China； Correspondingauthor，E-mail：jbzhu@ iris．sipp．ac．(H) Abstract：SeventYfivenodulingenes，found innucleotidedatabases，wereused asprobestoscan thericegenomeby bioinformaticsmethods．Thirty—onehomologuesofnodulingenesweredetectedinthericegenomewhichexhibitedmorethan 35 identitiesinaminoacidsequencesincomparisonwith leguminousnodulingenes．Thisresultindicatedthatleguminous nodulinhomologouSgenesexistedextensivelyin ricegenome．In comparisonwith thelegum inousnodulin geneenod40，SU— crosesynthasegeneandRabgene。theircorrespondinghomologuesinriceshowedthattheyallbelongedtOtheclassificationof orthologousgenes，presumablyoriginatedfrom thecommon ancestralgenes．However。leguminousnodulingenesmutated duringtheearlyevolutionSOastomeettherequirementsofnoduleorganogenesis．Theother44 leguminousnodulingenes， whichhaven0homologsinricegenome，playessentialrolesinestablishingsymbiosisbetweentheRhizobium andthehostleg umes．Itwassuggestedthatthelackoftheselegum inousnodulingenesinricemightresultinitsdisablilityfornodulationand nitrogenfixation． Keywords：Oryzasativa；leguminousplants；nodulingenes；orthologousgene 摘 要：以核酸数据库中检索到的75个豆科植物结瘤素基因作为探针 ，应用生物信息学方法对水稻基 因组进行扫描分 析 。在水稻基 因组 中发现有 31个与结瘤素基因具有同源性 的基 因，与相应的结瘤素基 因比对 ，它们 的氨基酸序列一致性至 少在 35 以上 。这表明在水稻基 因组 中广泛存在豆科植物结瘤素基 因的同源基因。豆科植物结瘤素基 因 enod40、