广东省新兴县鸭圆环病毒感染的PCR诊断及序列分析.pdfVIP

中国兽 医科学 2009，39(O2)：164—167 ChineseVeterinaryScience 中图分类号：S852．659．2：Q503 文献标志码 ：A 文章编号：1673—4696(2009)02—0164—04 广东省新兴县鸭圆环病毒感染的PCR诊断 及序列分析 黎 敏 ，宋延华，温纳相 ，周 全，周 丽，宋永峰 (广东温氏集团研究院，广东 新兴 527400) 摘要 ：根据已发表的鸭圆环病毒 (duckcircovirus，DuCV)序列，合成了1对检测引物。利用此对引物 对广东省新兴县发生的疑似圆环病毒感染的患病番鸭的肝、胰腺、心、肾、脾 、肺、血液、腔上囊、胸腺、哈氏腺、 粪便和羽毛进行 了PCR扩增。结果显示，获得 了与预期 6l9bp大小相符的DNA 片段 ，经测序确认其为 DuCV特异序列，证实鸭群感染了鸭圆环病毒 。然后，再设计 了2对引物从鸭组织提取的DNA 中扩增 出2 条片段 ，拼接校对后获得 了全基 因组序列，并对其进行 了分析。结果表明，在感染鸭体 内各组织器官中都有 DuCV存在 ，该株病毒基 因组序列全长为 1988bp，与部分 已登录GenBank的DuCV同源性高达 97．0 以上。 关键词：鸭；圆环病毒；聚合酶链式反应；序列分析 PCR detection andsequenceanalysisofduck circovirusinfection inXinxingCountyOfGuangdongProvince LIMin，SONG Yan—hua，WEN Na—xiang，ZHOU Quan，ZHOU Li，SONG Yong—feng (Guangdong ”’GroupAcademy，Xinxing527400，China) Abstract：A pairofdegeneratedprimerswas synthesizedbasedon thepublished duck circovirus (DuCV)sequences．ADNA fragmentof619bpwasamplifiedfrom extractsoftheliver，spleen，kidney，lab— ricius，thymus，glandofharder，heart，blood，lungandpancreasofcircovirus—likeinfectedducksinXinxing CountyofGuangdongProvinceusingtheprimers，respectively．Thefragmentwasthensequencedandanal— ysised．theresultshowed thattheseduckswere infectedwith DuCV indeed．TWO nucleotidefragments (1349bpand997bprespectively)wereamplifiedfrom DNA ofvarioustissuesoftheinfectedducksusing anothertwopairsofdegeneratedprimers．Aftertheyhadbeenassembled together，thegenomewereob— tainedandanalyzed．Theresultsshowed thatDuCV couldbedetectedinmostoftissuesoftheinfected ducks。theobtained sequencewasacircularDNA with atotallength of1988nt，andthegenomeshared highidentityofover97．0％ withsomeDuCV sequenceavailableinGenBank． Keywords：duck；circovirus；PCR；sequenceanalysis 圆环病毒科作为新设立的病毒科，是近年来兽 分别从福建生长缓慢的半番鸭及番鸭脾、腔上囊、肝 医界关注的畜禽类病毒之一 。圆环病毒为无囊膜、 中检测出鸭圆环病毒 ，并对其进行了全基因测序，测 大小为 15～16nm 的环形单股 DNA球形病毒，主